Protein–RNA interactions for Protein: Q8N9U0

TC2N, Tandem C2 domains nuclear protein, humanhuman

Predictions only

Length 490 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TC2NQ8N9U0 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TC2NQ8N9U0 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TC2NQ8N9U0 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TC2NQ8N9U0 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TC2NQ8N9U0 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TC2NQ8N9U0 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TC2NQ8N9U0 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TC2NQ8N9U0 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TC2NQ8N9U0 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TC2NQ8N9U0 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TC2NQ8N9U0 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
TC2NQ8N9U0 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TC2NQ8N9U0 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TC2NQ8N9U0 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
TC2NQ8N9U0 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TC2NQ8N9U0 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TC2NQ8N9U0 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TC2NQ8N9U0 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TC2NQ8N9U0 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TC2NQ8N9U0 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TC2NQ8N9U0 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
TC2NQ8N9U0 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TC2NQ8N9U0 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TC2NQ8N9U0 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TC2NQ8N9U0 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TC2NQ8N9U0 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TC2NQ8N9U0 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TC2NQ8N9U0 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
TC2NQ8N9U0 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TC2NQ8N9U0 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TC2NQ8N9U0 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TC2NQ8N9U0 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TC2NQ8N9U0 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TC2NQ8N9U0 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TC2NQ8N9U0 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
TC2NQ8N9U0 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TC2NQ8N9U0 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TC2NQ8N9U0 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TC2NQ8N9U0 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TC2NQ8N9U0 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TC2NQ8N9U0 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TC2NQ8N9U0 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TC2NQ8N9U0 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TC2NQ8N9U0 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TC2NQ8N9U0 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TC2NQ8N9U0 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TC2NQ8N9U0 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TC2NQ8N9U0 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TC2NQ8N9U0 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TC2NQ8N9U0 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TC2NQ8N9U0 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TC2NQ8N9U0 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TC2NQ8N9U0 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TC2NQ8N9U0 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TC2NQ8N9U0 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TC2NQ8N9U0 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TC2NQ8N9U0 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TC2NQ8N9U0 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TC2NQ8N9U0 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TC2NQ8N9U0 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TC2NQ8N9U0 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TC2NQ8N9U0 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TC2NQ8N9U0 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
TC2NQ8N9U0 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TC2NQ8N9U0 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TC2NQ8N9U0 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TC2NQ8N9U0 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TC2NQ8N9U0 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TC2NQ8N9U0 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TC2NQ8N9U0 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TC2NQ8N9U0 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TC2NQ8N9U0 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TC2NQ8N9U0 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TC2NQ8N9U0 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TC2NQ8N9U0 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TC2NQ8N9U0 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TC2NQ8N9U0 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TC2NQ8N9U0 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TC2NQ8N9U0 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TC2NQ8N9U0 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TC2NQ8N9U0 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TC2NQ8N9U0 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TC2NQ8N9U0 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TC2NQ8N9U0 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TC2NQ8N9U0 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TC2NQ8N9U0 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TC2NQ8N9U0 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TC2NQ8N9U0 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TC2NQ8N9U0 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TC2NQ8N9U0 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TC2NQ8N9U0 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TC2NQ8N9U0 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TC2NQ8N9U0 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
TC2NQ8N9U0 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
TC2NQ8N9U0 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TC2NQ8N9U0 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TC2NQ8N9U0 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TC2NQ8N9U0 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TC2NQ8N9U0 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TC2NQ8N9U0 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.5 ms