Protein–RNA interactions for Protein: Q8N9G6

Putative UPF0607 protein FLJ37424, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 341 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q8N9G6 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Q8N9G6 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Q8N9G6 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Q8N9G6 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Q8N9G6 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Q8N9G6 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
Q8N9G6 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Q8N9G6 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Q8N9G6 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Q8N9G6 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Q8N9G6 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Q8N9G6 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Q8N9G6 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Q8N9G6 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
Q8N9G6 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
Q8N9G6 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Q8N9G6 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Q8N9G6 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Q8N9G6 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.87
Q8N9G6 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Q8N9G6 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Q8N9G6 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Q8N9G6 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Q8N9G6 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Q8N9G6 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Q8N9G6 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Q8N9G6 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
Q8N9G6 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Q8N9G6 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Q8N9G6 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Q8N9G6 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Q8N9G6 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
Q8N9G6 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Q8N9G6 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Q8N9G6 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Q8N9G6 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Q8N9G6 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Q8N9G6 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Q8N9G6 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Q8N9G6 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Q8N9G6 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Q8N9G6 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Q8N9G6 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Q8N9G6 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Q8N9G6 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Q8N9G6 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Q8N9G6 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Q8N9G6 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Q8N9G6 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
Q8N9G6 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Q8N9G6 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Q8N9G6 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Q8N9G6 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Q8N9G6 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Q8N9G6 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Q8N9G6 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Q8N9G6 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Q8N9G6 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Q8N9G6 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Q8N9G6 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Q8N9G6 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Q8N9G6 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Q8N9G6 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Q8N9G6 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Q8N9G6 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Q8N9G6 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Q8N9G6 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Q8N9G6 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Q8N9G6 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Q8N9G6 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
Q8N9G6 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
Q8N9G6 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Q8N9G6 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Q8N9G6 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Q8N9G6 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Q8N9G6 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Q8N9G6 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Q8N9G6 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Q8N9G6 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Q8N9G6 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Q8N9G6 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Q8N9G6 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Q8N9G6 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Q8N9G6 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Q8N9G6 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Q8N9G6 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Q8N9G6 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Q8N9G6 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Q8N9G6 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Q8N9G6 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Q8N9G6 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Q8N9G6 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Q8N9G6 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Q8N9G6 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Q8N9G6 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Q8N9G6 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Q8N9G6 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Q8N9G6 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Q8N9G6 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Q8N9G6 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.2 ms