Protein–RNA interactions for Protein: Q8N8G6

C15orf54, Putative uncharacterized protein C15orf54, humanhuman

Predictions only

Length 183 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C15orf54Q8N8G6 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
C15orf54Q8N8G6 SSC5D-201ENST00000389623 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
C15orf54Q8N8G6 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
C15orf54Q8N8G6 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
C15orf54Q8N8G6 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
C15orf54Q8N8G6 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
C15orf54Q8N8G6 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
C15orf54Q8N8G6 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
C15orf54Q8N8G6 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
C15orf54Q8N8G6 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
C15orf54Q8N8G6 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
C15orf54Q8N8G6 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
C15orf54Q8N8G6 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
C15orf54Q8N8G6 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
C15orf54Q8N8G6 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
C15orf54Q8N8G6 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
C15orf54Q8N8G6 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
C15orf54Q8N8G6 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
C15orf54Q8N8G6 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
C15orf54Q8N8G6 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
C15orf54Q8N8G6 MFHAS1-201ENST00000276282 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
C15orf54Q8N8G6 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
C15orf54Q8N8G6 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
C15orf54Q8N8G6 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
C15orf54Q8N8G6 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
C15orf54Q8N8G6 ASCC2-202ENST00000397771 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
C15orf54Q8N8G6 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
C15orf54Q8N8G6 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
C15orf54Q8N8G6 MARK2-209ENST00000509502 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
C15orf54Q8N8G6 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
C15orf54Q8N8G6 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
C15orf54Q8N8G6 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
C15orf54Q8N8G6 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
C15orf54Q8N8G6 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
C15orf54Q8N8G6 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
C15orf54Q8N8G6 AC020916.1-201ENST00000587762 1774 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
C15orf54Q8N8G6 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
C15orf54Q8N8G6 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
C15orf54Q8N8G6 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
C15orf54Q8N8G6 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
C15orf54Q8N8G6 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
C15orf54Q8N8G6 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
C15orf54Q8N8G6 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
C15orf54Q8N8G6 PACSIN2-203ENST00000402229 1883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
C15orf54Q8N8G6 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
C15orf54Q8N8G6 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
C15orf54Q8N8G6 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
C15orf54Q8N8G6 ELL2-201ENST00000237853 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
C15orf54Q8N8G6 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
C15orf54Q8N8G6 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
C15orf54Q8N8G6 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
C15orf54Q8N8G6 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
C15orf54Q8N8G6 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
C15orf54Q8N8G6 RNF144A-201ENST00000320892 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
C15orf54Q8N8G6 SNTB2-201ENST00000336278 9789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
C15orf54Q8N8G6 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
C15orf54Q8N8G6 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
C15orf54Q8N8G6 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
C15orf54Q8N8G6 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
C15orf54Q8N8G6 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
C15orf54Q8N8G6 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
C15orf54Q8N8G6 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
C15orf54Q8N8G6 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
C15orf54Q8N8G6 HEBP2-204ENST00000607197 10014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
C15orf54Q8N8G6 SUSD2-201ENST00000358321 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
C15orf54Q8N8G6 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
C15orf54Q8N8G6 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
C15orf54Q8N8G6 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
C15orf54Q8N8G6 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
C15orf54Q8N8G6 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
C15orf54Q8N8G6 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
C15orf54Q8N8G6 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
C15orf54Q8N8G6 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
C15orf54Q8N8G6 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
C15orf54Q8N8G6 RALY-203ENST00000375114 6430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
C15orf54Q8N8G6 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
C15orf54Q8N8G6 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC16.58■□□□□ 0.25
C15orf54Q8N8G6 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
C15orf54Q8N8G6 EIF3J-201ENST00000261868 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
C15orf54Q8N8G6 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
C15orf54Q8N8G6 PLEKHG5-207ENST00000400913 4698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
C15orf54Q8N8G6 RALGAPA1-219ENST00000637992 8512 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
C15orf54Q8N8G6 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
C15orf54Q8N8G6 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
C15orf54Q8N8G6 CHST11-201ENST00000303694 5709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
C15orf54Q8N8G6 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
C15orf54Q8N8G6 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
C15orf54Q8N8G6 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
C15orf54Q8N8G6 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
C15orf54Q8N8G6 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
C15orf54Q8N8G6 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
C15orf54Q8N8G6 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
C15orf54Q8N8G6 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
C15orf54Q8N8G6 ARHGEF28-204ENST00000437974 5792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
C15orf54Q8N8G6 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
C15orf54Q8N8G6 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
C15orf54Q8N8G6 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
C15orf54Q8N8G6 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
C15orf54Q8N8G6 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
C15orf54Q8N8G6 FAM46A-203ENST00000369756 5537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.8 ms