Protein–RNA interactions for Protein: Q8N7U6

EFHB, EF-hand domain-containing family member B, humanhuman

Predictions only

Length 833 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFHBQ8N7U6 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
EFHBQ8N7U6 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
EFHBQ8N7U6 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
EFHBQ8N7U6 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
EFHBQ8N7U6 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
EFHBQ8N7U6 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
EFHBQ8N7U6 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
EFHBQ8N7U6 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
EFHBQ8N7U6 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
EFHBQ8N7U6 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
EFHBQ8N7U6 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
EFHBQ8N7U6 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
EFHBQ8N7U6 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
EFHBQ8N7U6 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
EFHBQ8N7U6 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
EFHBQ8N7U6 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
EFHBQ8N7U6 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
EFHBQ8N7U6 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
EFHBQ8N7U6 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
EFHBQ8N7U6 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
EFHBQ8N7U6 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
EFHBQ8N7U6 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
EFHBQ8N7U6 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
EFHBQ8N7U6 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
EFHBQ8N7U6 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
EFHBQ8N7U6 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
EFHBQ8N7U6 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
EFHBQ8N7U6 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
EFHBQ8N7U6 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
EFHBQ8N7U6 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
EFHBQ8N7U6 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
EFHBQ8N7U6 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
EFHBQ8N7U6 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
EFHBQ8N7U6 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
EFHBQ8N7U6 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
EFHBQ8N7U6 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
EFHBQ8N7U6 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
EFHBQ8N7U6 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
EFHBQ8N7U6 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
EFHBQ8N7U6 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
EFHBQ8N7U6 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
EFHBQ8N7U6 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
EFHBQ8N7U6 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
EFHBQ8N7U6 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
EFHBQ8N7U6 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
EFHBQ8N7U6 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
EFHBQ8N7U6 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
EFHBQ8N7U6 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
EFHBQ8N7U6 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
EFHBQ8N7U6 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
EFHBQ8N7U6 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
EFHBQ8N7U6 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
EFHBQ8N7U6 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
EFHBQ8N7U6 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
EFHBQ8N7U6 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
EFHBQ8N7U6 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
EFHBQ8N7U6 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
EFHBQ8N7U6 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC22.33■■□□□ 1.17
EFHBQ8N7U6 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
EFHBQ8N7U6 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
EFHBQ8N7U6 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
EFHBQ8N7U6 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
EFHBQ8N7U6 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
EFHBQ8N7U6 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
EFHBQ8N7U6 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
EFHBQ8N7U6 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
EFHBQ8N7U6 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
EFHBQ8N7U6 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
EFHBQ8N7U6 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
EFHBQ8N7U6 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
EFHBQ8N7U6 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
EFHBQ8N7U6 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
EFHBQ8N7U6 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
EFHBQ8N7U6 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
EFHBQ8N7U6 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
EFHBQ8N7U6 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
EFHBQ8N7U6 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
EFHBQ8N7U6 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
EFHBQ8N7U6 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
EFHBQ8N7U6 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
EFHBQ8N7U6 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
EFHBQ8N7U6 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
EFHBQ8N7U6 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
EFHBQ8N7U6 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
EFHBQ8N7U6 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
EFHBQ8N7U6 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
EFHBQ8N7U6 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
EFHBQ8N7U6 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
EFHBQ8N7U6 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
EFHBQ8N7U6 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
EFHBQ8N7U6 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
EFHBQ8N7U6 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
EFHBQ8N7U6 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
EFHBQ8N7U6 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
EFHBQ8N7U6 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
EFHBQ8N7U6 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
EFHBQ8N7U6 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
EFHBQ8N7U6 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
EFHBQ8N7U6 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
EFHBQ8N7U6 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.5 ms