Protein–RNA interactions for Protein: Q8N6S4

ANKRD13C, Ankyrin repeat domain-containing protein 13C, humanhuman

Predictions only

Length 541 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD13CQ8N6S4 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
ANKRD13CQ8N6S4 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
ANKRD13CQ8N6S4 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
ANKRD13CQ8N6S4 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
ANKRD13CQ8N6S4 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
ANKRD13CQ8N6S4 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
ANKRD13CQ8N6S4 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
ANKRD13CQ8N6S4 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
ANKRD13CQ8N6S4 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
ANKRD13CQ8N6S4 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
ANKRD13CQ8N6S4 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC24.42■■□□□ 1.5
ANKRD13CQ8N6S4 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
ANKRD13CQ8N6S4 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
ANKRD13CQ8N6S4 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC24.42■■□□□ 1.5
ANKRD13CQ8N6S4 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
ANKRD13CQ8N6S4 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
ANKRD13CQ8N6S4 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
ANKRD13CQ8N6S4 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
ANKRD13CQ8N6S4 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
ANKRD13CQ8N6S4 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
ANKRD13CQ8N6S4 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
ANKRD13CQ8N6S4 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
ANKRD13CQ8N6S4 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
ANKRD13CQ8N6S4 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
ANKRD13CQ8N6S4 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
ANKRD13CQ8N6S4 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
ANKRD13CQ8N6S4 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
ANKRD13CQ8N6S4 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
ANKRD13CQ8N6S4 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
ANKRD13CQ8N6S4 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
ANKRD13CQ8N6S4 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC24.41■■□□□ 1.5
ANKRD13CQ8N6S4 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
ANKRD13CQ8N6S4 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
ANKRD13CQ8N6S4 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
ANKRD13CQ8N6S4 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
ANKRD13CQ8N6S4 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
ANKRD13CQ8N6S4 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
ANKRD13CQ8N6S4 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
ANKRD13CQ8N6S4 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
ANKRD13CQ8N6S4 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
ANKRD13CQ8N6S4 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC24.4■■□□□ 1.5
ANKRD13CQ8N6S4 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
ANKRD13CQ8N6S4 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
ANKRD13CQ8N6S4 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
ANKRD13CQ8N6S4 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
ANKRD13CQ8N6S4 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
ANKRD13CQ8N6S4 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
ANKRD13CQ8N6S4 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
ANKRD13CQ8N6S4 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
ANKRD13CQ8N6S4 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
ANKRD13CQ8N6S4 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
ANKRD13CQ8N6S4 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC24.39■■□□□ 1.5
ANKRD13CQ8N6S4 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
ANKRD13CQ8N6S4 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
ANKRD13CQ8N6S4 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
ANKRD13CQ8N6S4 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC24.39■■□□□ 1.5
ANKRD13CQ8N6S4 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
ANKRD13CQ8N6S4 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC24.39■■□□□ 1.5
ANKRD13CQ8N6S4 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
ANKRD13CQ8N6S4 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
ANKRD13CQ8N6S4 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
ANKRD13CQ8N6S4 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
ANKRD13CQ8N6S4 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
ANKRD13CQ8N6S4 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
ANKRD13CQ8N6S4 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
ANKRD13CQ8N6S4 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
ANKRD13CQ8N6S4 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
ANKRD13CQ8N6S4 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
ANKRD13CQ8N6S4 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
ANKRD13CQ8N6S4 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
ANKRD13CQ8N6S4 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
ANKRD13CQ8N6S4 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
ANKRD13CQ8N6S4 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
ANKRD13CQ8N6S4 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
ANKRD13CQ8N6S4 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
ANKRD13CQ8N6S4 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
ANKRD13CQ8N6S4 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
ANKRD13CQ8N6S4 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
ANKRD13CQ8N6S4 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
ANKRD13CQ8N6S4 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
ANKRD13CQ8N6S4 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
ANKRD13CQ8N6S4 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
ANKRD13CQ8N6S4 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
ANKRD13CQ8N6S4 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
ANKRD13CQ8N6S4 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
ANKRD13CQ8N6S4 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC24.37■■□□□ 1.49
ANKRD13CQ8N6S4 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
ANKRD13CQ8N6S4 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
ANKRD13CQ8N6S4 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
ANKRD13CQ8N6S4 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
ANKRD13CQ8N6S4 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
ANKRD13CQ8N6S4 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
ANKRD13CQ8N6S4 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
ANKRD13CQ8N6S4 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
ANKRD13CQ8N6S4 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
ANKRD13CQ8N6S4 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
ANKRD13CQ8N6S4 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
ANKRD13CQ8N6S4 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
ANKRD13CQ8N6S4 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC24.36■■□□□ 1.49
ANKRD13CQ8N6S4 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.1 ms