Protein–RNA interactions for Protein: Q8N283

ANKRD35, Ankyrin repeat domain-containing protein 35, humanhuman

Predictions only

Length 1,001 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD35Q8N283 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
ANKRD35Q8N283 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
ANKRD35Q8N283 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
ANKRD35Q8N283 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
ANKRD35Q8N283 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
ANKRD35Q8N283 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
ANKRD35Q8N283 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
ANKRD35Q8N283 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
ANKRD35Q8N283 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
ANKRD35Q8N283 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC24.02■■□□□ 1.44
ANKRD35Q8N283 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
ANKRD35Q8N283 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
ANKRD35Q8N283 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
ANKRD35Q8N283 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
ANKRD35Q8N283 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
ANKRD35Q8N283 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC24.02■■□□□ 1.44
ANKRD35Q8N283 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
ANKRD35Q8N283 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
ANKRD35Q8N283 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
ANKRD35Q8N283 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
ANKRD35Q8N283 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
ANKRD35Q8N283 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
ANKRD35Q8N283 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
ANKRD35Q8N283 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
ANKRD35Q8N283 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
ANKRD35Q8N283 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
ANKRD35Q8N283 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
ANKRD35Q8N283 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
ANKRD35Q8N283 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
ANKRD35Q8N283 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
ANKRD35Q8N283 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
ANKRD35Q8N283 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
ANKRD35Q8N283 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
ANKRD35Q8N283 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
ANKRD35Q8N283 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
ANKRD35Q8N283 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
ANKRD35Q8N283 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
ANKRD35Q8N283 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
ANKRD35Q8N283 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
ANKRD35Q8N283 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
ANKRD35Q8N283 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
ANKRD35Q8N283 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
ANKRD35Q8N283 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
ANKRD35Q8N283 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
ANKRD35Q8N283 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
ANKRD35Q8N283 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
ANKRD35Q8N283 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
ANKRD35Q8N283 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
ANKRD35Q8N283 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
ANKRD35Q8N283 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
ANKRD35Q8N283 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
ANKRD35Q8N283 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
ANKRD35Q8N283 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
ANKRD35Q8N283 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
ANKRD35Q8N283 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
ANKRD35Q8N283 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
ANKRD35Q8N283 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
ANKRD35Q8N283 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
ANKRD35Q8N283 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
ANKRD35Q8N283 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
ANKRD35Q8N283 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
ANKRD35Q8N283 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
ANKRD35Q8N283 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
ANKRD35Q8N283 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
ANKRD35Q8N283 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
ANKRD35Q8N283 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
ANKRD35Q8N283 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
ANKRD35Q8N283 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
ANKRD35Q8N283 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
ANKRD35Q8N283 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
ANKRD35Q8N283 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
ANKRD35Q8N283 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
ANKRD35Q8N283 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
ANKRD35Q8N283 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
ANKRD35Q8N283 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
ANKRD35Q8N283 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
ANKRD35Q8N283 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
ANKRD35Q8N283 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
ANKRD35Q8N283 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
ANKRD35Q8N283 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
ANKRD35Q8N283 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
ANKRD35Q8N283 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
ANKRD35Q8N283 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
ANKRD35Q8N283 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
ANKRD35Q8N283 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
ANKRD35Q8N283 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
ANKRD35Q8N283 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
ANKRD35Q8N283 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
ANKRD35Q8N283 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
ANKRD35Q8N283 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC23.96■■□□□ 1.43
ANKRD35Q8N283 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
ANKRD35Q8N283 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
ANKRD35Q8N283 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
ANKRD35Q8N283 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
ANKRD35Q8N283 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
ANKRD35Q8N283 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
ANKRD35Q8N283 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.43
ANKRD35Q8N283 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
ANKRD35Q8N283 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.43
ANKRD35Q8N283 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.1 ms