Protein–RNA interactions for Protein: Q8IZ13

ZBED8, Protein ZBED8, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZBED8Q8IZ13 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ZBED8Q8IZ13 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ZBED8Q8IZ13 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
ZBED8Q8IZ13 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
ZBED8Q8IZ13 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
ZBED8Q8IZ13 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
ZBED8Q8IZ13 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
ZBED8Q8IZ13 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
ZBED8Q8IZ13 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
ZBED8Q8IZ13 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
ZBED8Q8IZ13 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
ZBED8Q8IZ13 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
ZBED8Q8IZ13 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
ZBED8Q8IZ13 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
ZBED8Q8IZ13 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
ZBED8Q8IZ13 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
ZBED8Q8IZ13 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
ZBED8Q8IZ13 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
ZBED8Q8IZ13 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
ZBED8Q8IZ13 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
ZBED8Q8IZ13 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
ZBED8Q8IZ13 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
ZBED8Q8IZ13 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
ZBED8Q8IZ13 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
ZBED8Q8IZ13 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
ZBED8Q8IZ13 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
ZBED8Q8IZ13 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
ZBED8Q8IZ13 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
ZBED8Q8IZ13 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
ZBED8Q8IZ13 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ZBED8Q8IZ13 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ZBED8Q8IZ13 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ZBED8Q8IZ13 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ZBED8Q8IZ13 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ZBED8Q8IZ13 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ZBED8Q8IZ13 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ZBED8Q8IZ13 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ZBED8Q8IZ13 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ZBED8Q8IZ13 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ZBED8Q8IZ13 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ZBED8Q8IZ13 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ZBED8Q8IZ13 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ZBED8Q8IZ13 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ZBED8Q8IZ13 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ZBED8Q8IZ13 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ZBED8Q8IZ13 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ZBED8Q8IZ13 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ZBED8Q8IZ13 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ZBED8Q8IZ13 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ZBED8Q8IZ13 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ZBED8Q8IZ13 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ZBED8Q8IZ13 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ZBED8Q8IZ13 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ZBED8Q8IZ13 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ZBED8Q8IZ13 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ZBED8Q8IZ13 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
ZBED8Q8IZ13 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
ZBED8Q8IZ13 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ZBED8Q8IZ13 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ZBED8Q8IZ13 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ZBED8Q8IZ13 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ZBED8Q8IZ13 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ZBED8Q8IZ13 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ZBED8Q8IZ13 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ZBED8Q8IZ13 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ZBED8Q8IZ13 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ZBED8Q8IZ13 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ZBED8Q8IZ13 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ZBED8Q8IZ13 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ZBED8Q8IZ13 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ZBED8Q8IZ13 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ZBED8Q8IZ13 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ZBED8Q8IZ13 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ZBED8Q8IZ13 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ZBED8Q8IZ13 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ZBED8Q8IZ13 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ZBED8Q8IZ13 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ZBED8Q8IZ13 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
ZBED8Q8IZ13 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ZBED8Q8IZ13 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ZBED8Q8IZ13 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ZBED8Q8IZ13 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ZBED8Q8IZ13 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
ZBED8Q8IZ13 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ZBED8Q8IZ13 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ZBED8Q8IZ13 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ZBED8Q8IZ13 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ZBED8Q8IZ13 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ZBED8Q8IZ13 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ZBED8Q8IZ13 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ZBED8Q8IZ13 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ZBED8Q8IZ13 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ZBED8Q8IZ13 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ZBED8Q8IZ13 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ZBED8Q8IZ13 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ZBED8Q8IZ13 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ZBED8Q8IZ13 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ZBED8Q8IZ13 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ZBED8Q8IZ13 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ZBED8Q8IZ13 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
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