Protein–RNA interactions for Protein: Q8IYR2

SMYD4, SET and MYND domain-containing protein 4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 804 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMYD4Q8IYR2 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SMYD4Q8IYR2 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SMYD4Q8IYR2 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SMYD4Q8IYR2 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SMYD4Q8IYR2 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SMYD4Q8IYR2 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SMYD4Q8IYR2 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SMYD4Q8IYR2 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SMYD4Q8IYR2 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SMYD4Q8IYR2 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SMYD4Q8IYR2 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SMYD4Q8IYR2 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SMYD4Q8IYR2 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SMYD4Q8IYR2 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
SMYD4Q8IYR2 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SMYD4Q8IYR2 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SMYD4Q8IYR2 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SMYD4Q8IYR2 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SMYD4Q8IYR2 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SMYD4Q8IYR2 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SMYD4Q8IYR2 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SMYD4Q8IYR2 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SMYD4Q8IYR2 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SMYD4Q8IYR2 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SMYD4Q8IYR2 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SMYD4Q8IYR2 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SMYD4Q8IYR2 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SMYD4Q8IYR2 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SMYD4Q8IYR2 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SMYD4Q8IYR2 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SMYD4Q8IYR2 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SMYD4Q8IYR2 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SMYD4Q8IYR2 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SMYD4Q8IYR2 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SMYD4Q8IYR2 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SMYD4Q8IYR2 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SMYD4Q8IYR2 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SMYD4Q8IYR2 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
SMYD4Q8IYR2 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SMYD4Q8IYR2 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SMYD4Q8IYR2 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SMYD4Q8IYR2 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SMYD4Q8IYR2 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SMYD4Q8IYR2 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SMYD4Q8IYR2 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SMYD4Q8IYR2 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SMYD4Q8IYR2 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SMYD4Q8IYR2 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SMYD4Q8IYR2 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SMYD4Q8IYR2 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SMYD4Q8IYR2 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SMYD4Q8IYR2 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SMYD4Q8IYR2 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SMYD4Q8IYR2 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SMYD4Q8IYR2 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SMYD4Q8IYR2 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SMYD4Q8IYR2 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SMYD4Q8IYR2 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SMYD4Q8IYR2 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SMYD4Q8IYR2 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SMYD4Q8IYR2 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SMYD4Q8IYR2 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SMYD4Q8IYR2 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SMYD4Q8IYR2 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SMYD4Q8IYR2 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SMYD4Q8IYR2 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SMYD4Q8IYR2 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SMYD4Q8IYR2 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SMYD4Q8IYR2 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SMYD4Q8IYR2 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SMYD4Q8IYR2 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SMYD4Q8IYR2 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SMYD4Q8IYR2 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
SMYD4Q8IYR2 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
SMYD4Q8IYR2 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
SMYD4Q8IYR2 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SMYD4Q8IYR2 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SMYD4Q8IYR2 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SMYD4Q8IYR2 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SMYD4Q8IYR2 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SMYD4Q8IYR2 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SMYD4Q8IYR2 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SMYD4Q8IYR2 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
SMYD4Q8IYR2 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SMYD4Q8IYR2 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SMYD4Q8IYR2 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SMYD4Q8IYR2 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SMYD4Q8IYR2 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SMYD4Q8IYR2 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SMYD4Q8IYR2 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SMYD4Q8IYR2 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SMYD4Q8IYR2 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SMYD4Q8IYR2 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SMYD4Q8IYR2 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
SMYD4Q8IYR2 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SMYD4Q8IYR2 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SMYD4Q8IYR2 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SMYD4Q8IYR2 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SMYD4Q8IYR2 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SMYD4Q8IYR2 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.5 ms