Protein–RNA interactions for Protein: Q8IXH7

NELFCD, Negative elongation factor C/D, humanhuman

Predictions only

Length 590 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NELFCDQ8IXH7 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
NELFCDQ8IXH7 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
NELFCDQ8IXH7 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
NELFCDQ8IXH7 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
NELFCDQ8IXH7 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
NELFCDQ8IXH7 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
NELFCDQ8IXH7 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
NELFCDQ8IXH7 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
NELFCDQ8IXH7 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
NELFCDQ8IXH7 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
NELFCDQ8IXH7 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
NELFCDQ8IXH7 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
NELFCDQ8IXH7 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
NELFCDQ8IXH7 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
NELFCDQ8IXH7 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
NELFCDQ8IXH7 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
NELFCDQ8IXH7 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
NELFCDQ8IXH7 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
NELFCDQ8IXH7 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
NELFCDQ8IXH7 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
NELFCDQ8IXH7 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
NELFCDQ8IXH7 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
NELFCDQ8IXH7 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
NELFCDQ8IXH7 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
NELFCDQ8IXH7 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
NELFCDQ8IXH7 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
NELFCDQ8IXH7 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
NELFCDQ8IXH7 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
NELFCDQ8IXH7 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
NELFCDQ8IXH7 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
NELFCDQ8IXH7 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
NELFCDQ8IXH7 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
NELFCDQ8IXH7 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
NELFCDQ8IXH7 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
NELFCDQ8IXH7 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
NELFCDQ8IXH7 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
NELFCDQ8IXH7 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
NELFCDQ8IXH7 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
NELFCDQ8IXH7 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
NELFCDQ8IXH7 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
NELFCDQ8IXH7 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
NELFCDQ8IXH7 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
NELFCDQ8IXH7 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
NELFCDQ8IXH7 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
NELFCDQ8IXH7 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
NELFCDQ8IXH7 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
NELFCDQ8IXH7 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
NELFCDQ8IXH7 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
NELFCDQ8IXH7 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
NELFCDQ8IXH7 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
NELFCDQ8IXH7 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
NELFCDQ8IXH7 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
NELFCDQ8IXH7 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
NELFCDQ8IXH7 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
NELFCDQ8IXH7 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
NELFCDQ8IXH7 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
NELFCDQ8IXH7 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
NELFCDQ8IXH7 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
NELFCDQ8IXH7 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
NELFCDQ8IXH7 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC23.17■■□□□ 1.3
NELFCDQ8IXH7 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
NELFCDQ8IXH7 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
NELFCDQ8IXH7 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
NELFCDQ8IXH7 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
NELFCDQ8IXH7 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
NELFCDQ8IXH7 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
NELFCDQ8IXH7 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
NELFCDQ8IXH7 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
NELFCDQ8IXH7 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
NELFCDQ8IXH7 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
NELFCDQ8IXH7 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
NELFCDQ8IXH7 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
NELFCDQ8IXH7 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
NELFCDQ8IXH7 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
NELFCDQ8IXH7 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
NELFCDQ8IXH7 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
NELFCDQ8IXH7 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
NELFCDQ8IXH7 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
NELFCDQ8IXH7 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
NELFCDQ8IXH7 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
NELFCDQ8IXH7 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
NELFCDQ8IXH7 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
NELFCDQ8IXH7 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
NELFCDQ8IXH7 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
NELFCDQ8IXH7 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
NELFCDQ8IXH7 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC23.15■■□□□ 1.3
NELFCDQ8IXH7 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
NELFCDQ8IXH7 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
NELFCDQ8IXH7 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
NELFCDQ8IXH7 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
NELFCDQ8IXH7 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
NELFCDQ8IXH7 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC23.15■■□□□ 1.3
NELFCDQ8IXH7 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
NELFCDQ8IXH7 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
NELFCDQ8IXH7 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
NELFCDQ8IXH7 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
NELFCDQ8IXH7 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
NELFCDQ8IXH7 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
NELFCDQ8IXH7 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC23.14■■□□□ 1.3
NELFCDQ8IXH7 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.4 ms