Protein–RNA interactions for Protein: Q8IVM0

CCDC50, Coiled-coil domain-containing protein 50, humanhuman

Predictions only

Length 306 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC50Q8IVM0 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCDC50Q8IVM0 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCDC50Q8IVM0 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCDC50Q8IVM0 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCDC50Q8IVM0 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCDC50Q8IVM0 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCDC50Q8IVM0 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCDC50Q8IVM0 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCDC50Q8IVM0 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCDC50Q8IVM0 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCDC50Q8IVM0 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCDC50Q8IVM0 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCDC50Q8IVM0 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCDC50Q8IVM0 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCDC50Q8IVM0 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCDC50Q8IVM0 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCDC50Q8IVM0 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCDC50Q8IVM0 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCDC50Q8IVM0 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCDC50Q8IVM0 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCDC50Q8IVM0 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCDC50Q8IVM0 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCDC50Q8IVM0 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCDC50Q8IVM0 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCDC50Q8IVM0 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCDC50Q8IVM0 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCDC50Q8IVM0 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCDC50Q8IVM0 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCDC50Q8IVM0 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCDC50Q8IVM0 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
CCDC50Q8IVM0 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCDC50Q8IVM0 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCDC50Q8IVM0 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCDC50Q8IVM0 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCDC50Q8IVM0 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCDC50Q8IVM0 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCDC50Q8IVM0 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCDC50Q8IVM0 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCDC50Q8IVM0 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCDC50Q8IVM0 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CCDC50Q8IVM0 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CCDC50Q8IVM0 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CCDC50Q8IVM0 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CCDC50Q8IVM0 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CCDC50Q8IVM0 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CCDC50Q8IVM0 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CCDC50Q8IVM0 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CCDC50Q8IVM0 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CCDC50Q8IVM0 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
CCDC50Q8IVM0 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CCDC50Q8IVM0 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CCDC50Q8IVM0 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CCDC50Q8IVM0 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CCDC50Q8IVM0 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
CCDC50Q8IVM0 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
CCDC50Q8IVM0 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
CCDC50Q8IVM0 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCDC50Q8IVM0 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCDC50Q8IVM0 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCDC50Q8IVM0 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCDC50Q8IVM0 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCDC50Q8IVM0 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCDC50Q8IVM0 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
CCDC50Q8IVM0 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCDC50Q8IVM0 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
CCDC50Q8IVM0 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCDC50Q8IVM0 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCDC50Q8IVM0 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCDC50Q8IVM0 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCDC50Q8IVM0 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCDC50Q8IVM0 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCDC50Q8IVM0 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC50Q8IVM0 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC50Q8IVM0 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC50Q8IVM0 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC50Q8IVM0 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC50Q8IVM0 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC50Q8IVM0 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC50Q8IVM0 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC50Q8IVM0 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC50Q8IVM0 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC50Q8IVM0 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC50Q8IVM0 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC50Q8IVM0 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC50Q8IVM0 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCDC50Q8IVM0 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCDC50Q8IVM0 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCDC50Q8IVM0 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCDC50Q8IVM0 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCDC50Q8IVM0 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCDC50Q8IVM0 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCDC50Q8IVM0 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCDC50Q8IVM0 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCDC50Q8IVM0 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCDC50Q8IVM0 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
CCDC50Q8IVM0 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCDC50Q8IVM0 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCDC50Q8IVM0 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCDC50Q8IVM0 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCDC50Q8IVM0 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.8 ms