Protein–RNA interactions for Protein: Q8IVB4

SLC9A9, Sodium/hydrogen exchanger 9, humanhuman

Predictions only

Length 645 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC9A9Q8IVB4 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SLC9A9Q8IVB4 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SLC9A9Q8IVB4 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SLC9A9Q8IVB4 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
SLC9A9Q8IVB4 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
SLC9A9Q8IVB4 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.26
SLC9A9Q8IVB4 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
SLC9A9Q8IVB4 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
SLC9A9Q8IVB4 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
SLC9A9Q8IVB4 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
SLC9A9Q8IVB4 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
SLC9A9Q8IVB4 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SLC9A9Q8IVB4 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SLC9A9Q8IVB4 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SLC9A9Q8IVB4 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SLC9A9Q8IVB4 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SLC9A9Q8IVB4 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SLC9A9Q8IVB4 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SLC9A9Q8IVB4 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SLC9A9Q8IVB4 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SLC9A9Q8IVB4 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SLC9A9Q8IVB4 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SLC9A9Q8IVB4 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SLC9A9Q8IVB4 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SLC9A9Q8IVB4 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SLC9A9Q8IVB4 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SLC9A9Q8IVB4 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SLC9A9Q8IVB4 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SLC9A9Q8IVB4 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SLC9A9Q8IVB4 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
SLC9A9Q8IVB4 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SLC9A9Q8IVB4 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SLC9A9Q8IVB4 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SLC9A9Q8IVB4 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SLC9A9Q8IVB4 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SLC9A9Q8IVB4 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SLC9A9Q8IVB4 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SLC9A9Q8IVB4 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SLC9A9Q8IVB4 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SLC9A9Q8IVB4 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SLC9A9Q8IVB4 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SLC9A9Q8IVB4 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SLC9A9Q8IVB4 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SLC9A9Q8IVB4 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SLC9A9Q8IVB4 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SLC9A9Q8IVB4 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SLC9A9Q8IVB4 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SLC9A9Q8IVB4 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
SLC9A9Q8IVB4 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SLC9A9Q8IVB4 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SLC9A9Q8IVB4 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SLC9A9Q8IVB4 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SLC9A9Q8IVB4 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
SLC9A9Q8IVB4 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SLC9A9Q8IVB4 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
SLC9A9Q8IVB4 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SLC9A9Q8IVB4 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SLC9A9Q8IVB4 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SLC9A9Q8IVB4 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SLC9A9Q8IVB4 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SLC9A9Q8IVB4 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SLC9A9Q8IVB4 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SLC9A9Q8IVB4 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SLC9A9Q8IVB4 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SLC9A9Q8IVB4 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SLC9A9Q8IVB4 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SLC9A9Q8IVB4 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SLC9A9Q8IVB4 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SLC9A9Q8IVB4 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SLC9A9Q8IVB4 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SLC9A9Q8IVB4 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SLC9A9Q8IVB4 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SLC9A9Q8IVB4 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SLC9A9Q8IVB4 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SLC9A9Q8IVB4 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SLC9A9Q8IVB4 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SLC9A9Q8IVB4 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SLC9A9Q8IVB4 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SLC9A9Q8IVB4 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
SLC9A9Q8IVB4 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SLC9A9Q8IVB4 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SLC9A9Q8IVB4 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SLC9A9Q8IVB4 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SLC9A9Q8IVB4 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SLC9A9Q8IVB4 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SLC9A9Q8IVB4 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SLC9A9Q8IVB4 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SLC9A9Q8IVB4 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SLC9A9Q8IVB4 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SLC9A9Q8IVB4 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SLC9A9Q8IVB4 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SLC9A9Q8IVB4 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SLC9A9Q8IVB4 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
SLC9A9Q8IVB4 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SLC9A9Q8IVB4 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SLC9A9Q8IVB4 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SLC9A9Q8IVB4 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SLC9A9Q8IVB4 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SLC9A9Q8IVB4 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SLC9A9Q8IVB4 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.2 ms