Protein–RNA interactions for Protein: Q8IV31

TMEM139, Transmembrane protein 139, humanhuman

Predictions only

Length 216 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM139Q8IV31 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TMEM139Q8IV31 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TMEM139Q8IV31 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TMEM139Q8IV31 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TMEM139Q8IV31 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TMEM139Q8IV31 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TMEM139Q8IV31 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TMEM139Q8IV31 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TMEM139Q8IV31 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TMEM139Q8IV31 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TMEM139Q8IV31 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TMEM139Q8IV31 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TMEM139Q8IV31 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TMEM139Q8IV31 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TMEM139Q8IV31 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TMEM139Q8IV31 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TMEM139Q8IV31 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TMEM139Q8IV31 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TMEM139Q8IV31 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TMEM139Q8IV31 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TMEM139Q8IV31 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TMEM139Q8IV31 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TMEM139Q8IV31 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
TMEM139Q8IV31 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TMEM139Q8IV31 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TMEM139Q8IV31 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TMEM139Q8IV31 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TMEM139Q8IV31 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TMEM139Q8IV31 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TMEM139Q8IV31 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TMEM139Q8IV31 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TMEM139Q8IV31 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TMEM139Q8IV31 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TMEM139Q8IV31 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TMEM139Q8IV31 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
TMEM139Q8IV31 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TMEM139Q8IV31 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TMEM139Q8IV31 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
TMEM139Q8IV31 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
TMEM139Q8IV31 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TMEM139Q8IV31 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
TMEM139Q8IV31 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
TMEM139Q8IV31 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
TMEM139Q8IV31 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
TMEM139Q8IV31 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
TMEM139Q8IV31 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
TMEM139Q8IV31 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TMEM139Q8IV31 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TMEM139Q8IV31 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
TMEM139Q8IV31 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TMEM139Q8IV31 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TMEM139Q8IV31 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
TMEM139Q8IV31 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
TMEM139Q8IV31 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
TMEM139Q8IV31 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
TMEM139Q8IV31 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
TMEM139Q8IV31 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
TMEM139Q8IV31 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
TMEM139Q8IV31 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
TMEM139Q8IV31 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
TMEM139Q8IV31 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
TMEM139Q8IV31 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
TMEM139Q8IV31 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
TMEM139Q8IV31 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
TMEM139Q8IV31 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
TMEM139Q8IV31 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
TMEM139Q8IV31 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
TMEM139Q8IV31 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
TMEM139Q8IV31 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TMEM139Q8IV31 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TMEM139Q8IV31 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
TMEM139Q8IV31 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TMEM139Q8IV31 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TMEM139Q8IV31 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TMEM139Q8IV31 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TMEM139Q8IV31 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TMEM139Q8IV31 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
TMEM139Q8IV31 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TMEM139Q8IV31 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
TMEM139Q8IV31 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
TMEM139Q8IV31 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TMEM139Q8IV31 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TMEM139Q8IV31 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
TMEM139Q8IV31 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TMEM139Q8IV31 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TMEM139Q8IV31 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TMEM139Q8IV31 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
TMEM139Q8IV31 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TMEM139Q8IV31 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TMEM139Q8IV31 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TMEM139Q8IV31 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TMEM139Q8IV31 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TMEM139Q8IV31 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
TMEM139Q8IV31 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
TMEM139Q8IV31 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
TMEM139Q8IV31 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
TMEM139Q8IV31 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TMEM139Q8IV31 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
TMEM139Q8IV31 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TMEM139Q8IV31 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.7 ms