Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z7A3

CTU1, Cytoplasmic tRNA 2-thiolation protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 348 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTU1Q7Z7A3 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CTU1Q7Z7A3 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CTU1Q7Z7A3 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CTU1Q7Z7A3 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CTU1Q7Z7A3 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
CTU1Q7Z7A3 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CTU1Q7Z7A3 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CTU1Q7Z7A3 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CTU1Q7Z7A3 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
CTU1Q7Z7A3 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CTU1Q7Z7A3 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CTU1Q7Z7A3 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CTU1Q7Z7A3 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CTU1Q7Z7A3 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CTU1Q7Z7A3 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CTU1Q7Z7A3 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CTU1Q7Z7A3 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CTU1Q7Z7A3 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CTU1Q7Z7A3 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CTU1Q7Z7A3 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CTU1Q7Z7A3 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CTU1Q7Z7A3 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
CTU1Q7Z7A3 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CTU1Q7Z7A3 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
CTU1Q7Z7A3 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CTU1Q7Z7A3 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CTU1Q7Z7A3 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CTU1Q7Z7A3 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CTU1Q7Z7A3 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CTU1Q7Z7A3 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
CTU1Q7Z7A3 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CTU1Q7Z7A3 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CTU1Q7Z7A3 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CTU1Q7Z7A3 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CTU1Q7Z7A3 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CTU1Q7Z7A3 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
CTU1Q7Z7A3 RNF146-204ENST00000476956 884 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CTU1Q7Z7A3 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CTU1Q7Z7A3 AC106791.1-202ENST00000508281 1148 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CTU1Q7Z7A3 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CTU1Q7Z7A3 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
CTU1Q7Z7A3 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CTU1Q7Z7A3 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CTU1Q7Z7A3 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CTU1Q7Z7A3 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CTU1Q7Z7A3 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CTU1Q7Z7A3 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
CTU1Q7Z7A3 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CTU1Q7Z7A3 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CTU1Q7Z7A3 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CTU1Q7Z7A3 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CTU1Q7Z7A3 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CTU1Q7Z7A3 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CTU1Q7Z7A3 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CTU1Q7Z7A3 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CTU1Q7Z7A3 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CTU1Q7Z7A3 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CTU1Q7Z7A3 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
CTU1Q7Z7A3 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CTU1Q7Z7A3 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CTU1Q7Z7A3 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CTU1Q7Z7A3 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CTU1Q7Z7A3 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CTU1Q7Z7A3 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CTU1Q7Z7A3 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CTU1Q7Z7A3 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CTU1Q7Z7A3 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CTU1Q7Z7A3 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CTU1Q7Z7A3 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CTU1Q7Z7A3 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CTU1Q7Z7A3 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
CTU1Q7Z7A3 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
CTU1Q7Z7A3 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CTU1Q7Z7A3 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CTU1Q7Z7A3 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CTU1Q7Z7A3 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CTU1Q7Z7A3 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CTU1Q7Z7A3 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CTU1Q7Z7A3 ATP6V0C-203ENST00000565223 668 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CTU1Q7Z7A3 ATP6V0C-204ENST00000568562 477 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CTU1Q7Z7A3 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
CTU1Q7Z7A3 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
CTU1Q7Z7A3 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
CTU1Q7Z7A3 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CTU1Q7Z7A3 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CTU1Q7Z7A3 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CTU1Q7Z7A3 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CTU1Q7Z7A3 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CTU1Q7Z7A3 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CTU1Q7Z7A3 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CTU1Q7Z7A3 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CTU1Q7Z7A3 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CTU1Q7Z7A3 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CTU1Q7Z7A3 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CTU1Q7Z7A3 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CTU1Q7Z7A3 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CTU1Q7Z7A3 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CTU1Q7Z7A3 PDCD2L-203ENST00000587065 492 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CTU1Q7Z7A3 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
CTU1Q7Z7A3 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.2 ms