Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z5S9

TMEM144, Transmembrane protein 144, humanhuman

Predictions only

Length 345 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM144Q7Z5S9 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TMEM144Q7Z5S9 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
TMEM144Q7Z5S9 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
TMEM144Q7Z5S9 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TMEM144Q7Z5S9 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
TMEM144Q7Z5S9 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
TMEM144Q7Z5S9 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
TMEM144Q7Z5S9 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
TMEM144Q7Z5S9 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TMEM144Q7Z5S9 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TMEM144Q7Z5S9 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
TMEM144Q7Z5S9 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
TMEM144Q7Z5S9 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TMEM144Q7Z5S9 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
TMEM144Q7Z5S9 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
TMEM144Q7Z5S9 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TMEM144Q7Z5S9 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
TMEM144Q7Z5S9 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TMEM144Q7Z5S9 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TMEM144Q7Z5S9 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
TMEM144Q7Z5S9 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
TMEM144Q7Z5S9 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TMEM144Q7Z5S9 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TMEM144Q7Z5S9 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
TMEM144Q7Z5S9 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TMEM144Q7Z5S9 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TMEM144Q7Z5S9 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
TMEM144Q7Z5S9 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
TMEM144Q7Z5S9 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
TMEM144Q7Z5S9 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TMEM144Q7Z5S9 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
TMEM144Q7Z5S9 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
TMEM144Q7Z5S9 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
TMEM144Q7Z5S9 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
TMEM144Q7Z5S9 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TMEM144Q7Z5S9 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TMEM144Q7Z5S9 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TMEM144Q7Z5S9 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
TMEM144Q7Z5S9 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
TMEM144Q7Z5S9 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
TMEM144Q7Z5S9 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
TMEM144Q7Z5S9 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
TMEM144Q7Z5S9 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
TMEM144Q7Z5S9 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
TMEM144Q7Z5S9 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TMEM144Q7Z5S9 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
TMEM144Q7Z5S9 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TMEM144Q7Z5S9 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TMEM144Q7Z5S9 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TMEM144Q7Z5S9 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
TMEM144Q7Z5S9 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
TMEM144Q7Z5S9 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TMEM144Q7Z5S9 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
TMEM144Q7Z5S9 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TMEM144Q7Z5S9 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TMEM144Q7Z5S9 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
TMEM144Q7Z5S9 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
TMEM144Q7Z5S9 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
TMEM144Q7Z5S9 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TMEM144Q7Z5S9 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TMEM144Q7Z5S9 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TMEM144Q7Z5S9 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TMEM144Q7Z5S9 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
TMEM144Q7Z5S9 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TMEM144Q7Z5S9 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TMEM144Q7Z5S9 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
TMEM144Q7Z5S9 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TMEM144Q7Z5S9 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TMEM144Q7Z5S9 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TMEM144Q7Z5S9 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TMEM144Q7Z5S9 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TMEM144Q7Z5S9 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TMEM144Q7Z5S9 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TMEM144Q7Z5S9 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TMEM144Q7Z5S9 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TMEM144Q7Z5S9 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
TMEM144Q7Z5S9 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TMEM144Q7Z5S9 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TMEM144Q7Z5S9 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TMEM144Q7Z5S9 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TMEM144Q7Z5S9 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TMEM144Q7Z5S9 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TMEM144Q7Z5S9 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TMEM144Q7Z5S9 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TMEM144Q7Z5S9 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TMEM144Q7Z5S9 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TMEM144Q7Z5S9 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TMEM144Q7Z5S9 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TMEM144Q7Z5S9 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TMEM144Q7Z5S9 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
TMEM144Q7Z5S9 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TMEM144Q7Z5S9 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TMEM144Q7Z5S9 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TMEM144Q7Z5S9 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TMEM144Q7Z5S9 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TMEM144Q7Z5S9 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TMEM144Q7Z5S9 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TMEM144Q7Z5S9 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TMEM144Q7Z5S9 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TMEM144Q7Z5S9 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.5 ms