Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZRZ4

C9orf47, Uncharacterized protein C9orf47, humanhuman

Predictions only

Length 202 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf47Q6ZRZ4 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
C9orf47Q6ZRZ4 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC15.68■□□□□ 0.1
C9orf47Q6ZRZ4 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
C9orf47Q6ZRZ4 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
C9orf47Q6ZRZ4 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
C9orf47Q6ZRZ4 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
C9orf47Q6ZRZ4 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
C9orf47Q6ZRZ4 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC15.68■□□□□ 0.1
C9orf47Q6ZRZ4 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
C9orf47Q6ZRZ4 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
C9orf47Q6ZRZ4 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
C9orf47Q6ZRZ4 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
C9orf47Q6ZRZ4 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
C9orf47Q6ZRZ4 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
C9orf47Q6ZRZ4 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC15.68■□□□□ 0.1
C9orf47Q6ZRZ4 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
C9orf47Q6ZRZ4 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
C9orf47Q6ZRZ4 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
C9orf47Q6ZRZ4 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
C9orf47Q6ZRZ4 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
C9orf47Q6ZRZ4 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
C9orf47Q6ZRZ4 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
C9orf47Q6ZRZ4 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
C9orf47Q6ZRZ4 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
C9orf47Q6ZRZ4 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
C9orf47Q6ZRZ4 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
C9orf47Q6ZRZ4 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
C9orf47Q6ZRZ4 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
C9orf47Q6ZRZ4 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
C9orf47Q6ZRZ4 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
C9orf47Q6ZRZ4 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
C9orf47Q6ZRZ4 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
C9orf47Q6ZRZ4 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
C9orf47Q6ZRZ4 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
C9orf47Q6ZRZ4 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
C9orf47Q6ZRZ4 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
C9orf47Q6ZRZ4 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
C9orf47Q6ZRZ4 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
C9orf47Q6ZRZ4 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
C9orf47Q6ZRZ4 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
C9orf47Q6ZRZ4 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
C9orf47Q6ZRZ4 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
C9orf47Q6ZRZ4 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
C9orf47Q6ZRZ4 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
C9orf47Q6ZRZ4 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
C9orf47Q6ZRZ4 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
C9orf47Q6ZRZ4 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
C9orf47Q6ZRZ4 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
C9orf47Q6ZRZ4 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
C9orf47Q6ZRZ4 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
C9orf47Q6ZRZ4 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
C9orf47Q6ZRZ4 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
C9orf47Q6ZRZ4 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
C9orf47Q6ZRZ4 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
C9orf47Q6ZRZ4 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
C9orf47Q6ZRZ4 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
C9orf47Q6ZRZ4 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
C9orf47Q6ZRZ4 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
C9orf47Q6ZRZ4 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
C9orf47Q6ZRZ4 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
C9orf47Q6ZRZ4 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
C9orf47Q6ZRZ4 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
C9orf47Q6ZRZ4 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
C9orf47Q6ZRZ4 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
C9orf47Q6ZRZ4 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
C9orf47Q6ZRZ4 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
C9orf47Q6ZRZ4 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
C9orf47Q6ZRZ4 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
C9orf47Q6ZRZ4 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
C9orf47Q6ZRZ4 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
C9orf47Q6ZRZ4 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
C9orf47Q6ZRZ4 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
C9orf47Q6ZRZ4 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
C9orf47Q6ZRZ4 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
C9orf47Q6ZRZ4 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
C9orf47Q6ZRZ4 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
C9orf47Q6ZRZ4 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
C9orf47Q6ZRZ4 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
C9orf47Q6ZRZ4 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC15.65■□□□□ 0.1
C9orf47Q6ZRZ4 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
C9orf47Q6ZRZ4 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
C9orf47Q6ZRZ4 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
C9orf47Q6ZRZ4 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
C9orf47Q6ZRZ4 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
C9orf47Q6ZRZ4 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
C9orf47Q6ZRZ4 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
C9orf47Q6ZRZ4 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
C9orf47Q6ZRZ4 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
C9orf47Q6ZRZ4 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.1
C9orf47Q6ZRZ4 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.1
C9orf47Q6ZRZ4 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
C9orf47Q6ZRZ4 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
C9orf47Q6ZRZ4 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
C9orf47Q6ZRZ4 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
C9orf47Q6ZRZ4 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
C9orf47Q6ZRZ4 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
C9orf47Q6ZRZ4 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
C9orf47Q6ZRZ4 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
C9orf47Q6ZRZ4 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
C9orf47Q6ZRZ4 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.6 ms