Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZRS2

SRCAP, Helicase SRCAP, humanhuman

Predictions only

Length 3,230 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRCAPQ6ZRS2 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
SRCAPQ6ZRS2 TMEM42-201ENST00000302392 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
SRCAPQ6ZRS2 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
SRCAPQ6ZRS2 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
SRCAPQ6ZRS2 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC26.91■■□□□ 1.9
SRCAPQ6ZRS2 AC027682.6-202ENST00000621378 795 ntTSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
SRCAPQ6ZRS2 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
SRCAPQ6ZRS2 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
SRCAPQ6ZRS2 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
SRCAPQ6ZRS2 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
SRCAPQ6ZRS2 NAA50-209ENST00000497525 1385 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
SRCAPQ6ZRS2 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
SRCAPQ6ZRS2 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
SRCAPQ6ZRS2 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC26.9■■□□□ 1.9
SRCAPQ6ZRS2 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
SRCAPQ6ZRS2 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
SRCAPQ6ZRS2 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.9■■□□□ 1.9
SRCAPQ6ZRS2 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
SRCAPQ6ZRS2 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
SRCAPQ6ZRS2 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
SRCAPQ6ZRS2 IPPK-202ENST00000375522 882 ntTSL 3 BASIC26.9■■□□□ 1.9
SRCAPQ6ZRS2 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
SRCAPQ6ZRS2 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
SRCAPQ6ZRS2 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
SRCAPQ6ZRS2 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
SRCAPQ6ZRS2 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
SRCAPQ6ZRS2 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
SRCAPQ6ZRS2 BIRC5-207ENST00000590449 568 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
SRCAPQ6ZRS2 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
SRCAPQ6ZRS2 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.89
SRCAPQ6ZRS2 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
SRCAPQ6ZRS2 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
SRCAPQ6ZRS2 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.89■■□□□ 1.89
SRCAPQ6ZRS2 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC26.89■■□□□ 1.89
SRCAPQ6ZRS2 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC26.89■■□□□ 1.89
SRCAPQ6ZRS2 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.89
SRCAPQ6ZRS2 SPCS1-201ENST00000233025 1082 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
SRCAPQ6ZRS2 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
SRCAPQ6ZRS2 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
SRCAPQ6ZRS2 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
SRCAPQ6ZRS2 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
SRCAPQ6ZRS2 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
SRCAPQ6ZRS2 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
SRCAPQ6ZRS2 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
SRCAPQ6ZRS2 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
SRCAPQ6ZRS2 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
SRCAPQ6ZRS2 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
SRCAPQ6ZRS2 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
SRCAPQ6ZRS2 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
SRCAPQ6ZRS2 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
SRCAPQ6ZRS2 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
SRCAPQ6ZRS2 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
SRCAPQ6ZRS2 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
SRCAPQ6ZRS2 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
SRCAPQ6ZRS2 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
SRCAPQ6ZRS2 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
SRCAPQ6ZRS2 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
SRCAPQ6ZRS2 CHCHD3-203ENST00000448878 1038 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
SRCAPQ6ZRS2 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
SRCAPQ6ZRS2 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC26.87■■□□□ 1.89
SRCAPQ6ZRS2 DCTN3-201ENST00000259632 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
SRCAPQ6ZRS2 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
SRCAPQ6ZRS2 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC26.86■■□□□ 1.89
SRCAPQ6ZRS2 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
SRCAPQ6ZRS2 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
SRCAPQ6ZRS2 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
SRCAPQ6ZRS2 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
SRCAPQ6ZRS2 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
SRCAPQ6ZRS2 TYROBP-205ENST00000585901 620 ntTSL 3 BASIC26.86■■□□□ 1.89
SRCAPQ6ZRS2 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
SRCAPQ6ZRS2 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
SRCAPQ6ZRS2 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
SRCAPQ6ZRS2 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC26.85■■□□□ 1.89
SRCAPQ6ZRS2 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
SRCAPQ6ZRS2 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
SRCAPQ6ZRS2 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
SRCAPQ6ZRS2 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC26.85■■□□□ 1.89
SRCAPQ6ZRS2 PP7080-204ENST00000510714 601 ntTSL 3 BASIC26.85■■□□□ 1.89
SRCAPQ6ZRS2 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
SRCAPQ6ZRS2 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
SRCAPQ6ZRS2 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
SRCAPQ6ZRS2 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC26.84■■□□□ 1.89
SRCAPQ6ZRS2 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
SRCAPQ6ZRS2 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
SRCAPQ6ZRS2 AC246785.2-201ENST00000432512 513 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
SRCAPQ6ZRS2 AC139530.3-201ENST00000620344 690 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
SRCAPQ6ZRS2 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
SRCAPQ6ZRS2 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
SRCAPQ6ZRS2 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
SRCAPQ6ZRS2 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
SRCAPQ6ZRS2 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
SRCAPQ6ZRS2 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
SRCAPQ6ZRS2 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
SRCAPQ6ZRS2 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
SRCAPQ6ZRS2 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
SRCAPQ6ZRS2 STX10-207ENST00000589083 1241 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
SRCAPQ6ZRS2 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
SRCAPQ6ZRS2 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
SRCAPQ6ZRS2 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
SRCAPQ6ZRS2 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.6 ms