Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZRR7

LRRC9, Leucine-rich repeat-containing protein 9, humanhuman

Predictions only

Length 1,453 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC9Q6ZRR7 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.55■■■□□ 2.8
LRRC9Q6ZRR7 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC32.54■■■□□ 2.8
LRRC9Q6ZRR7 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC32.54■■■□□ 2.8
LRRC9Q6ZRR7 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC32.54■■■□□ 2.8
LRRC9Q6ZRR7 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC32.54■■■□□ 2.8
LRRC9Q6ZRR7 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC32.54■■■□□ 2.8
LRRC9Q6ZRR7 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC32.54■■■□□ 2.8
LRRC9Q6ZRR7 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC32.54■■■□□ 2.8
LRRC9Q6ZRR7 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC32.54■■■□□ 2.8
LRRC9Q6ZRR7 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.54■■■□□ 2.8
LRRC9Q6ZRR7 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC32.54■■■□□ 2.8
LRRC9Q6ZRR7 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC32.54■■■□□ 2.8
LRRC9Q6ZRR7 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC32.54■■■□□ 2.8
LRRC9Q6ZRR7 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC32.54■■■□□ 2.8
LRRC9Q6ZRR7 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC32.54■■■□□ 2.8
LRRC9Q6ZRR7 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC32.54■■■□□ 2.8
LRRC9Q6ZRR7 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC32.54■■■□□ 2.8
LRRC9Q6ZRR7 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC32.53■■■□□ 2.8
LRRC9Q6ZRR7 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC32.53■■■□□ 2.8
LRRC9Q6ZRR7 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.53■■■□□ 2.8
LRRC9Q6ZRR7 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC32.53■■■□□ 2.8
LRRC9Q6ZRR7 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC32.53■■■□□ 2.8
LRRC9Q6ZRR7 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC32.53■■■□□ 2.8
LRRC9Q6ZRR7 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.52■■■□□ 2.8
LRRC9Q6ZRR7 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.52■■■□□ 2.8
LRRC9Q6ZRR7 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.52■■■□□ 2.8
LRRC9Q6ZRR7 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC32.52■■■□□ 2.8
LRRC9Q6ZRR7 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.52■■■□□ 2.8
LRRC9Q6ZRR7 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.52■■■□□ 2.8
LRRC9Q6ZRR7 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC32.52■■■□□ 2.8
LRRC9Q6ZRR7 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC32.52■■■□□ 2.8
LRRC9Q6ZRR7 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC32.52■■■□□ 2.8
LRRC9Q6ZRR7 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.52■■■□□ 2.8
LRRC9Q6ZRR7 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC32.52■■■□□ 2.8
LRRC9Q6ZRR7 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC32.52■■■□□ 2.8
LRRC9Q6ZRR7 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC32.52■■■□□ 2.8
LRRC9Q6ZRR7 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.52■■■□□ 2.8
LRRC9Q6ZRR7 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.52■■■□□ 2.8
LRRC9Q6ZRR7 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.52■■■□□ 2.8
LRRC9Q6ZRR7 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.52■■■□□ 2.8
LRRC9Q6ZRR7 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.52■■■□□ 2.8
LRRC9Q6ZRR7 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC32.51■■■□□ 2.8
LRRC9Q6ZRR7 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.51■■■□□ 2.8
LRRC9Q6ZRR7 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC32.51■■■□□ 2.8
LRRC9Q6ZRR7 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC32.51■■■□□ 2.8
LRRC9Q6ZRR7 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.51■■■□□ 2.8
LRRC9Q6ZRR7 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.51■■■□□ 2.8
LRRC9Q6ZRR7 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.51■■■□□ 2.79
LRRC9Q6ZRR7 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC32.51■■■□□ 2.79
LRRC9Q6ZRR7 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC32.51■■■□□ 2.79
LRRC9Q6ZRR7 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC32.51■■■□□ 2.79
LRRC9Q6ZRR7 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC32.51■■■□□ 2.79
LRRC9Q6ZRR7 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC32.51■■■□□ 2.79
LRRC9Q6ZRR7 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC32.51■■■□□ 2.79
LRRC9Q6ZRR7 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.51■■■□□ 2.79
LRRC9Q6ZRR7 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC32.51■■■□□ 2.79
LRRC9Q6ZRR7 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.5■■■□□ 2.79
LRRC9Q6ZRR7 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC32.5■■■□□ 2.79
LRRC9Q6ZRR7 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC32.5■■■□□ 2.79
LRRC9Q6ZRR7 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC32.5■■■□□ 2.79
LRRC9Q6ZRR7 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC32.5■■■□□ 2.79
LRRC9Q6ZRR7 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC32.5■■■□□ 2.79
LRRC9Q6ZRR7 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.5■■■□□ 2.79
LRRC9Q6ZRR7 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.49■■■□□ 2.79
LRRC9Q6ZRR7 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.49■■■□□ 2.79
LRRC9Q6ZRR7 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC32.49■■■□□ 2.79
LRRC9Q6ZRR7 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC32.49■■■□□ 2.79
LRRC9Q6ZRR7 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC32.48■■■□□ 2.79
LRRC9Q6ZRR7 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC32.48■■■□□ 2.79
LRRC9Q6ZRR7 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC32.48■■■□□ 2.79
LRRC9Q6ZRR7 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC32.48■■■□□ 2.79
LRRC9Q6ZRR7 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC32.48■■■□□ 2.79
LRRC9Q6ZRR7 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.48■■■□□ 2.79
LRRC9Q6ZRR7 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC32.48■■■□□ 2.79
LRRC9Q6ZRR7 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC32.48■■■□□ 2.79
LRRC9Q6ZRR7 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.47■■■□□ 2.79
LRRC9Q6ZRR7 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.47■■■□□ 2.79
LRRC9Q6ZRR7 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.47■■■□□ 2.79
LRRC9Q6ZRR7 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.47■■■□□ 2.79
LRRC9Q6ZRR7 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC32.47■■■□□ 2.79
LRRC9Q6ZRR7 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC32.47■■■□□ 2.79
LRRC9Q6ZRR7 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC32.47■■■□□ 2.79
LRRC9Q6ZRR7 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.47■■■□□ 2.79
LRRC9Q6ZRR7 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC32.47■■■□□ 2.79
LRRC9Q6ZRR7 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC32.47■■■□□ 2.79
LRRC9Q6ZRR7 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.46■■■□□ 2.79
LRRC9Q6ZRR7 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC32.46■■■□□ 2.79
LRRC9Q6ZRR7 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.46■■■□□ 2.79
LRRC9Q6ZRR7 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC32.46■■■□□ 2.79
LRRC9Q6ZRR7 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC32.46■■■□□ 2.79
LRRC9Q6ZRR7 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC32.46■■■□□ 2.79
LRRC9Q6ZRR7 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC32.46■■■□□ 2.79
LRRC9Q6ZRR7 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC32.46■■■□□ 2.79
LRRC9Q6ZRR7 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC32.46■■■□□ 2.79
LRRC9Q6ZRR7 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC32.46■■■□□ 2.79
LRRC9Q6ZRR7 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.46■■■□□ 2.79
LRRC9Q6ZRR7 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC32.46■■■□□ 2.79
LRRC9Q6ZRR7 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC32.45■■■□□ 2.79
LRRC9Q6ZRR7 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC32.45■■■□□ 2.79
LRRC9Q6ZRR7 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC32.45■■■□□ 2.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.4 ms