Protein–RNA interactions for Protein: Q6UWJ1

TMCO3, Transmembrane and coiled-coil domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 677 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMCO3Q6UWJ1 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TMCO3Q6UWJ1 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TMCO3Q6UWJ1 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TMCO3Q6UWJ1 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TMCO3Q6UWJ1 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TMCO3Q6UWJ1 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TMCO3Q6UWJ1 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TMCO3Q6UWJ1 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TMCO3Q6UWJ1 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TMCO3Q6UWJ1 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TMCO3Q6UWJ1 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TMCO3Q6UWJ1 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TMCO3Q6UWJ1 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TMCO3Q6UWJ1 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TMCO3Q6UWJ1 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TMCO3Q6UWJ1 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TMCO3Q6UWJ1 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TMCO3Q6UWJ1 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TMCO3Q6UWJ1 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TMCO3Q6UWJ1 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TMCO3Q6UWJ1 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TMCO3Q6UWJ1 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TMCO3Q6UWJ1 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TMCO3Q6UWJ1 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TMCO3Q6UWJ1 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TMCO3Q6UWJ1 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
TMCO3Q6UWJ1 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TMCO3Q6UWJ1 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TMCO3Q6UWJ1 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
TMCO3Q6UWJ1 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
TMCO3Q6UWJ1 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TMCO3Q6UWJ1 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TMCO3Q6UWJ1 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TMCO3Q6UWJ1 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TMCO3Q6UWJ1 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TMCO3Q6UWJ1 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
TMCO3Q6UWJ1 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
TMCO3Q6UWJ1 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
TMCO3Q6UWJ1 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
TMCO3Q6UWJ1 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
TMCO3Q6UWJ1 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
TMCO3Q6UWJ1 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
TMCO3Q6UWJ1 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
TMCO3Q6UWJ1 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
TMCO3Q6UWJ1 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
TMCO3Q6UWJ1 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
TMCO3Q6UWJ1 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
TMCO3Q6UWJ1 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
TMCO3Q6UWJ1 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
TMCO3Q6UWJ1 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
TMCO3Q6UWJ1 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
TMCO3Q6UWJ1 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TMCO3Q6UWJ1 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
TMCO3Q6UWJ1 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TMCO3Q6UWJ1 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
TMCO3Q6UWJ1 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
TMCO3Q6UWJ1 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
TMCO3Q6UWJ1 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
TMCO3Q6UWJ1 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TMCO3Q6UWJ1 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
TMCO3Q6UWJ1 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
TMCO3Q6UWJ1 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
TMCO3Q6UWJ1 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TMCO3Q6UWJ1 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC22.63■■□□□ 1.21
TMCO3Q6UWJ1 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC22.63■■□□□ 1.21
TMCO3Q6UWJ1 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TMCO3Q6UWJ1 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TMCO3Q6UWJ1 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TMCO3Q6UWJ1 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
TMCO3Q6UWJ1 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
TMCO3Q6UWJ1 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TMCO3Q6UWJ1 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TMCO3Q6UWJ1 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TMCO3Q6UWJ1 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
TMCO3Q6UWJ1 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TMCO3Q6UWJ1 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TMCO3Q6UWJ1 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
TMCO3Q6UWJ1 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
TMCO3Q6UWJ1 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TMCO3Q6UWJ1 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TMCO3Q6UWJ1 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TMCO3Q6UWJ1 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TMCO3Q6UWJ1 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
TMCO3Q6UWJ1 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
TMCO3Q6UWJ1 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TMCO3Q6UWJ1 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TMCO3Q6UWJ1 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TMCO3Q6UWJ1 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TMCO3Q6UWJ1 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TMCO3Q6UWJ1 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TMCO3Q6UWJ1 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TMCO3Q6UWJ1 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TMCO3Q6UWJ1 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
TMCO3Q6UWJ1 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
TMCO3Q6UWJ1 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TMCO3Q6UWJ1 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TMCO3Q6UWJ1 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
TMCO3Q6UWJ1 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TMCO3Q6UWJ1 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TMCO3Q6UWJ1 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.6 ms