Protein–RNA interactions for Protein: Q6U841

SLC4A10, Sodium-driven chloride bicarbonate exchanger, humanhuman

Predictions only

Length 1,118 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC4A10Q6U841 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
SLC4A10Q6U841 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
SLC4A10Q6U841 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
SLC4A10Q6U841 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
SLC4A10Q6U841 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
SLC4A10Q6U841 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
SLC4A10Q6U841 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
SLC4A10Q6U841 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
SLC4A10Q6U841 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
SLC4A10Q6U841 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
SLC4A10Q6U841 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
SLC4A10Q6U841 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
SLC4A10Q6U841 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
SLC4A10Q6U841 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
SLC4A10Q6U841 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
SLC4A10Q6U841 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
SLC4A10Q6U841 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
SLC4A10Q6U841 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
SLC4A10Q6U841 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC26.69■■□□□ 1.86
SLC4A10Q6U841 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
SLC4A10Q6U841 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
SLC4A10Q6U841 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
SLC4A10Q6U841 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
SLC4A10Q6U841 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
SLC4A10Q6U841 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
SLC4A10Q6U841 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
SLC4A10Q6U841 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
SLC4A10Q6U841 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
SLC4A10Q6U841 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
SLC4A10Q6U841 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
SLC4A10Q6U841 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
SLC4A10Q6U841 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
SLC4A10Q6U841 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
SLC4A10Q6U841 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
SLC4A10Q6U841 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
SLC4A10Q6U841 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
SLC4A10Q6U841 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
SLC4A10Q6U841 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC26.68■■□□□ 1.86
SLC4A10Q6U841 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
SLC4A10Q6U841 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
SLC4A10Q6U841 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
SLC4A10Q6U841 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
SLC4A10Q6U841 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
SLC4A10Q6U841 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
SLC4A10Q6U841 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
SLC4A10Q6U841 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
SLC4A10Q6U841 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
SLC4A10Q6U841 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC26.67■■□□□ 1.86
SLC4A10Q6U841 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC26.67■■□□□ 1.86
SLC4A10Q6U841 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
SLC4A10Q6U841 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
SLC4A10Q6U841 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
SLC4A10Q6U841 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
SLC4A10Q6U841 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
SLC4A10Q6U841 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
SLC4A10Q6U841 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
SLC4A10Q6U841 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
SLC4A10Q6U841 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
SLC4A10Q6U841 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
SLC4A10Q6U841 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.66■■□□□ 1.86
SLC4A10Q6U841 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC26.66■■□□□ 1.86
SLC4A10Q6U841 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
SLC4A10Q6U841 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC26.66■■□□□ 1.86
SLC4A10Q6U841 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
SLC4A10Q6U841 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC26.66■■□□□ 1.86
SLC4A10Q6U841 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
SLC4A10Q6U841 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
SLC4A10Q6U841 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC26.66■■□□□ 1.86
SLC4A10Q6U841 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
SLC4A10Q6U841 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
SLC4A10Q6U841 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
SLC4A10Q6U841 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
SLC4A10Q6U841 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
SLC4A10Q6U841 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
SLC4A10Q6U841 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
SLC4A10Q6U841 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
SLC4A10Q6U841 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
SLC4A10Q6U841 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
SLC4A10Q6U841 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
SLC4A10Q6U841 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
SLC4A10Q6U841 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC26.65■■□□□ 1.86
SLC4A10Q6U841 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
SLC4A10Q6U841 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
SLC4A10Q6U841 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
SLC4A10Q6U841 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
SLC4A10Q6U841 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
SLC4A10Q6U841 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
SLC4A10Q6U841 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
SLC4A10Q6U841 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
SLC4A10Q6U841 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.64■■□□□ 1.86
SLC4A10Q6U841 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
SLC4A10Q6U841 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
SLC4A10Q6U841 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
SLC4A10Q6U841 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
SLC4A10Q6U841 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
SLC4A10Q6U841 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
SLC4A10Q6U841 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
SLC4A10Q6U841 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
SLC4A10Q6U841 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
SLC4A10Q6U841 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.5 ms