Protein–RNA interactions for Protein: Q6QNY1

BLOC1S2, Biogenesis of lysosome-related organelles complex 1 subunit 2, humanhuman

Predictions only

Length 142 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BLOC1S2Q6QNY1 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
BLOC1S2Q6QNY1 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
BLOC1S2Q6QNY1 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
BLOC1S2Q6QNY1 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
BLOC1S2Q6QNY1 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
BLOC1S2Q6QNY1 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
BLOC1S2Q6QNY1 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
BLOC1S2Q6QNY1 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
BLOC1S2Q6QNY1 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
BLOC1S2Q6QNY1 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
BLOC1S2Q6QNY1 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
BLOC1S2Q6QNY1 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
BLOC1S2Q6QNY1 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
BLOC1S2Q6QNY1 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
BLOC1S2Q6QNY1 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
BLOC1S2Q6QNY1 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
BLOC1S2Q6QNY1 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
BLOC1S2Q6QNY1 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
BLOC1S2Q6QNY1 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
BLOC1S2Q6QNY1 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
BLOC1S2Q6QNY1 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
BLOC1S2Q6QNY1 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
BLOC1S2Q6QNY1 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
BLOC1S2Q6QNY1 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
BLOC1S2Q6QNY1 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
BLOC1S2Q6QNY1 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
BLOC1S2Q6QNY1 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
BLOC1S2Q6QNY1 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC24.89■■□□□ 1.58
BLOC1S2Q6QNY1 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
BLOC1S2Q6QNY1 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
BLOC1S2Q6QNY1 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
BLOC1S2Q6QNY1 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
BLOC1S2Q6QNY1 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
BLOC1S2Q6QNY1 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
BLOC1S2Q6QNY1 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
BLOC1S2Q6QNY1 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
BLOC1S2Q6QNY1 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
BLOC1S2Q6QNY1 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
BLOC1S2Q6QNY1 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
BLOC1S2Q6QNY1 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
BLOC1S2Q6QNY1 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
BLOC1S2Q6QNY1 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
BLOC1S2Q6QNY1 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
BLOC1S2Q6QNY1 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
BLOC1S2Q6QNY1 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
BLOC1S2Q6QNY1 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
BLOC1S2Q6QNY1 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
BLOC1S2Q6QNY1 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
BLOC1S2Q6QNY1 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
BLOC1S2Q6QNY1 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
BLOC1S2Q6QNY1 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
BLOC1S2Q6QNY1 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
BLOC1S2Q6QNY1 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
BLOC1S2Q6QNY1 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
BLOC1S2Q6QNY1 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
BLOC1S2Q6QNY1 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC24.86■■□□□ 1.57
BLOC1S2Q6QNY1 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
BLOC1S2Q6QNY1 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
BLOC1S2Q6QNY1 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
BLOC1S2Q6QNY1 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
BLOC1S2Q6QNY1 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
BLOC1S2Q6QNY1 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
BLOC1S2Q6QNY1 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
BLOC1S2Q6QNY1 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
BLOC1S2Q6QNY1 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
BLOC1S2Q6QNY1 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
BLOC1S2Q6QNY1 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
BLOC1S2Q6QNY1 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
BLOC1S2Q6QNY1 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
BLOC1S2Q6QNY1 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
BLOC1S2Q6QNY1 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
BLOC1S2Q6QNY1 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
BLOC1S2Q6QNY1 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
BLOC1S2Q6QNY1 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
BLOC1S2Q6QNY1 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
BLOC1S2Q6QNY1 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
BLOC1S2Q6QNY1 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
BLOC1S2Q6QNY1 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
BLOC1S2Q6QNY1 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
BLOC1S2Q6QNY1 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
BLOC1S2Q6QNY1 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC24.83■■□□□ 1.57
BLOC1S2Q6QNY1 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
BLOC1S2Q6QNY1 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
BLOC1S2Q6QNY1 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
BLOC1S2Q6QNY1 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
BLOC1S2Q6QNY1 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
BLOC1S2Q6QNY1 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.56
BLOC1S2Q6QNY1 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
BLOC1S2Q6QNY1 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.56
BLOC1S2Q6QNY1 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
BLOC1S2Q6QNY1 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
BLOC1S2Q6QNY1 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
BLOC1S2Q6QNY1 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
BLOC1S2Q6QNY1 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
BLOC1S2Q6QNY1 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
BLOC1S2Q6QNY1 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
BLOC1S2Q6QNY1 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
BLOC1S2Q6QNY1 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
BLOC1S2Q6QNY1 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
BLOC1S2Q6QNY1 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.7 ms