Protein–RNA interactions for Protein: Q6PB30

CSAG1, Putative chondrosarcoma-associated gene 1 protein, humanhuman

Predictions only

Length 78 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSAG1Q6PB30 WNK1-206ENST00000535572 9886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
CSAG1Q6PB30 GTF2IP4-202ENST00000544802 3609 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
CSAG1Q6PB30 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
CSAG1Q6PB30 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
CSAG1Q6PB30 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
CSAG1Q6PB30 CRKL-201ENST00000354336 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
CSAG1Q6PB30 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
CSAG1Q6PB30 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
CSAG1Q6PB30 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC10.74□□□□□ -0.69
CSAG1Q6PB30 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.74□□□□□ -0.69
CSAG1Q6PB30 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC10.74□□□□□ -0.69
CSAG1Q6PB30 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC10.74□□□□□ -0.69
CSAG1Q6PB30 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.74□□□□□ -0.69
CSAG1Q6PB30 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
CSAG1Q6PB30 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.74□□□□□ -0.69
CSAG1Q6PB30 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
CSAG1Q6PB30 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
CSAG1Q6PB30 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
CSAG1Q6PB30 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
CSAG1Q6PB30 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
CSAG1Q6PB30 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
CSAG1Q6PB30 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
CSAG1Q6PB30 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
CSAG1Q6PB30 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
CSAG1Q6PB30 TLL1-204ENST00000507499 4818 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
CSAG1Q6PB30 HPGD-213ENST00000541923 2920 ntTSL 2 BASIC10.74□□□□□ -0.69
CSAG1Q6PB30 ALDH1A3-201ENST00000329841 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
CSAG1Q6PB30 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
CSAG1Q6PB30 EHMT1-203ENST00000460843 5137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
CSAG1Q6PB30 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
CSAG1Q6PB30 ZNF74-202ENST00000400451 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
CSAG1Q6PB30 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.73□□□□□ -0.69
CSAG1Q6PB30 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
CSAG1Q6PB30 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
CSAG1Q6PB30 TRIM33-201ENST00000358465 8339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
CSAG1Q6PB30 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
CSAG1Q6PB30 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
CSAG1Q6PB30 TLK2-203ENST00000346027 3449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
CSAG1Q6PB30 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
CSAG1Q6PB30 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
CSAG1Q6PB30 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
CSAG1Q6PB30 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.73□□□□□ -0.69
CSAG1Q6PB30 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
CSAG1Q6PB30 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC10.73□□□□□ -0.69
CSAG1Q6PB30 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC10.73□□□□□ -0.69
CSAG1Q6PB30 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
CSAG1Q6PB30 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
CSAG1Q6PB30 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
CSAG1Q6PB30 IQSEC2-202ENST00000396435 6015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
CSAG1Q6PB30 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
CSAG1Q6PB30 CNOT6-202ENST00000393356 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
CSAG1Q6PB30 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC10.73□□□□□ -0.69
CSAG1Q6PB30 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
CSAG1Q6PB30 CPEB3-203ENST00000614585 5789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
CSAG1Q6PB30 ADARB1-202ENST00000360697 6604 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
CSAG1Q6PB30 ADCY8-201ENST00000286355 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
CSAG1Q6PB30 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
CSAG1Q6PB30 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC10.73□□□□□ -0.69
CSAG1Q6PB30 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
CSAG1Q6PB30 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
CSAG1Q6PB30 AHSA2-202ENST00000394457 6574 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
CSAG1Q6PB30 CNTNAP3-204ENST00000377656 4986 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
CSAG1Q6PB30 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC10.73□□□□□ -0.69
CSAG1Q6PB30 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
CSAG1Q6PB30 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
CSAG1Q6PB30 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
CSAG1Q6PB30 DMRTA1-201ENST00000325870 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
CSAG1Q6PB30 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
CSAG1Q6PB30 RNF128-201ENST00000255499 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
CSAG1Q6PB30 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
CSAG1Q6PB30 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
CSAG1Q6PB30 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
CSAG1Q6PB30 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
CSAG1Q6PB30 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
CSAG1Q6PB30 MAGI3-201ENST00000307546 6430 ntTSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
CSAG1Q6PB30 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
CSAG1Q6PB30 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
CSAG1Q6PB30 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC10.72□□□□□ -0.69
CSAG1Q6PB30 VASH1-201ENST00000167106 5728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
CSAG1Q6PB30 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
CSAG1Q6PB30 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
CSAG1Q6PB30 BMP2K-201ENST00000335016 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
CSAG1Q6PB30 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
CSAG1Q6PB30 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC10.72□□□□□ -0.69
CSAG1Q6PB30 BMP2K-208ENST00000628286 3848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
CSAG1Q6PB30 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC10.72□□□□□ -0.69
CSAG1Q6PB30 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
CSAG1Q6PB30 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
CSAG1Q6PB30 USP32-201ENST00000300896 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
CSAG1Q6PB30 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
CSAG1Q6PB30 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.72□□□□□ -0.69
CSAG1Q6PB30 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC10.72□□□□□ -0.69
CSAG1Q6PB30 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
CSAG1Q6PB30 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
CSAG1Q6PB30 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.72□□□□□ -0.69
CSAG1Q6PB30 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.72□□□□□ -0.69
CSAG1Q6PB30 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.72□□□□□ -0.69
CSAG1Q6PB30 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
CSAG1Q6PB30 SPAG9-202ENST00000357122 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
CSAG1Q6PB30 TSC2-201ENST00000219476 6156 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.2 ms