Protein–RNA interactions for Protein: Q6NW29

RWDD4, RWD domain-containing protein 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 188 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RWDD4Q6NW29 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
RWDD4Q6NW29 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
RWDD4Q6NW29 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
RWDD4Q6NW29 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
RWDD4Q6NW29 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
RWDD4Q6NW29 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
RWDD4Q6NW29 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
RWDD4Q6NW29 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
RWDD4Q6NW29 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
RWDD4Q6NW29 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
RWDD4Q6NW29 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
RWDD4Q6NW29 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
RWDD4Q6NW29 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
RWDD4Q6NW29 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
RWDD4Q6NW29 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
RWDD4Q6NW29 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
RWDD4Q6NW29 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
RWDD4Q6NW29 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
RWDD4Q6NW29 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
RWDD4Q6NW29 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC21.79■■□□□ 1.08
RWDD4Q6NW29 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
RWDD4Q6NW29 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
RWDD4Q6NW29 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
RWDD4Q6NW29 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
RWDD4Q6NW29 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
RWDD4Q6NW29 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
RWDD4Q6NW29 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
RWDD4Q6NW29 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
RWDD4Q6NW29 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
RWDD4Q6NW29 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
RWDD4Q6NW29 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
RWDD4Q6NW29 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
RWDD4Q6NW29 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
RWDD4Q6NW29 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
RWDD4Q6NW29 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
RWDD4Q6NW29 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
RWDD4Q6NW29 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
RWDD4Q6NW29 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
RWDD4Q6NW29 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
RWDD4Q6NW29 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
RWDD4Q6NW29 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
RWDD4Q6NW29 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
RWDD4Q6NW29 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
RWDD4Q6NW29 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
RWDD4Q6NW29 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
RWDD4Q6NW29 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC21.78■■□□□ 1.08
RWDD4Q6NW29 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
RWDD4Q6NW29 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
RWDD4Q6NW29 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
RWDD4Q6NW29 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
RWDD4Q6NW29 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
RWDD4Q6NW29 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
RWDD4Q6NW29 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
RWDD4Q6NW29 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
RWDD4Q6NW29 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
RWDD4Q6NW29 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
RWDD4Q6NW29 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
RWDD4Q6NW29 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
RWDD4Q6NW29 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
RWDD4Q6NW29 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
RWDD4Q6NW29 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
RWDD4Q6NW29 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
RWDD4Q6NW29 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
RWDD4Q6NW29 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
RWDD4Q6NW29 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.07
RWDD4Q6NW29 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.07
RWDD4Q6NW29 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
RWDD4Q6NW29 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
RWDD4Q6NW29 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
RWDD4Q6NW29 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
RWDD4Q6NW29 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
RWDD4Q6NW29 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
RWDD4Q6NW29 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
RWDD4Q6NW29 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
RWDD4Q6NW29 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
RWDD4Q6NW29 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
RWDD4Q6NW29 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
RWDD4Q6NW29 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
RWDD4Q6NW29 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC21.76■■□□□ 1.07
RWDD4Q6NW29 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
RWDD4Q6NW29 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
RWDD4Q6NW29 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
RWDD4Q6NW29 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
RWDD4Q6NW29 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
RWDD4Q6NW29 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
RWDD4Q6NW29 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
RWDD4Q6NW29 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
RWDD4Q6NW29 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
RWDD4Q6NW29 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
RWDD4Q6NW29 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
RWDD4Q6NW29 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
RWDD4Q6NW29 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
RWDD4Q6NW29 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
RWDD4Q6NW29 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
RWDD4Q6NW29 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
RWDD4Q6NW29 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
RWDD4Q6NW29 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
RWDD4Q6NW29 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
RWDD4Q6NW29 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
RWDD4Q6NW29 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.9 ms