Protein–RNA interactions for Protein: Q6NVU6

UFSP1, Inactive Ufm1-specific protease 1, humanhuman

Predictions only

Length 142 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UFSP1Q6NVU6 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
UFSP1Q6NVU6 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
UFSP1Q6NVU6 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
UFSP1Q6NVU6 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
UFSP1Q6NVU6 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
UFSP1Q6NVU6 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
UFSP1Q6NVU6 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC15.3■□□□□ 0.04
UFSP1Q6NVU6 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
UFSP1Q6NVU6 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
UFSP1Q6NVU6 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
UFSP1Q6NVU6 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
UFSP1Q6NVU6 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
UFSP1Q6NVU6 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
UFSP1Q6NVU6 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
UFSP1Q6NVU6 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
UFSP1Q6NVU6 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
UFSP1Q6NVU6 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
UFSP1Q6NVU6 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
UFSP1Q6NVU6 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
UFSP1Q6NVU6 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
UFSP1Q6NVU6 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
UFSP1Q6NVU6 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
UFSP1Q6NVU6 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
UFSP1Q6NVU6 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
UFSP1Q6NVU6 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
UFSP1Q6NVU6 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
UFSP1Q6NVU6 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
UFSP1Q6NVU6 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
UFSP1Q6NVU6 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
UFSP1Q6NVU6 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
UFSP1Q6NVU6 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
UFSP1Q6NVU6 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
UFSP1Q6NVU6 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
UFSP1Q6NVU6 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
UFSP1Q6NVU6 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
UFSP1Q6NVU6 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
UFSP1Q6NVU6 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
UFSP1Q6NVU6 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
UFSP1Q6NVU6 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
UFSP1Q6NVU6 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
UFSP1Q6NVU6 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
UFSP1Q6NVU6 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
UFSP1Q6NVU6 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
UFSP1Q6NVU6 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
UFSP1Q6NVU6 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
UFSP1Q6NVU6 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
UFSP1Q6NVU6 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
UFSP1Q6NVU6 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
UFSP1Q6NVU6 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
UFSP1Q6NVU6 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
UFSP1Q6NVU6 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
UFSP1Q6NVU6 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
UFSP1Q6NVU6 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
UFSP1Q6NVU6 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
UFSP1Q6NVU6 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
UFSP1Q6NVU6 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
UFSP1Q6NVU6 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
UFSP1Q6NVU6 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
UFSP1Q6NVU6 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
UFSP1Q6NVU6 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
UFSP1Q6NVU6 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
UFSP1Q6NVU6 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
UFSP1Q6NVU6 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
UFSP1Q6NVU6 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
UFSP1Q6NVU6 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
UFSP1Q6NVU6 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
UFSP1Q6NVU6 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
UFSP1Q6NVU6 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
UFSP1Q6NVU6 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
UFSP1Q6NVU6 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
UFSP1Q6NVU6 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
UFSP1Q6NVU6 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
UFSP1Q6NVU6 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
UFSP1Q6NVU6 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
UFSP1Q6NVU6 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
UFSP1Q6NVU6 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
UFSP1Q6NVU6 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
UFSP1Q6NVU6 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
UFSP1Q6NVU6 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
UFSP1Q6NVU6 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
UFSP1Q6NVU6 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
UFSP1Q6NVU6 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
UFSP1Q6NVU6 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
UFSP1Q6NVU6 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
UFSP1Q6NVU6 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
UFSP1Q6NVU6 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
UFSP1Q6NVU6 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
UFSP1Q6NVU6 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
UFSP1Q6NVU6 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
UFSP1Q6NVU6 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
UFSP1Q6NVU6 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
UFSP1Q6NVU6 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
UFSP1Q6NVU6 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
UFSP1Q6NVU6 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
UFSP1Q6NVU6 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
UFSP1Q6NVU6 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
UFSP1Q6NVU6 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
UFSP1Q6NVU6 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
UFSP1Q6NVU6 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
UFSP1Q6NVU6 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.5 ms