Protein–RNA interactions for Protein: Q6NSW7

NANOGP8, Putative homeobox protein NANOGP8, humanhuman

Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NANOGP8Q6NSW7 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
NANOGP8Q6NSW7 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
NANOGP8Q6NSW7 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC19.94■□□□□ 0.78
NANOGP8Q6NSW7 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
NANOGP8Q6NSW7 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
NANOGP8Q6NSW7 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
NANOGP8Q6NSW7 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
NANOGP8Q6NSW7 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
NANOGP8Q6NSW7 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
NANOGP8Q6NSW7 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
NANOGP8Q6NSW7 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
NANOGP8Q6NSW7 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
NANOGP8Q6NSW7 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
NANOGP8Q6NSW7 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
NANOGP8Q6NSW7 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
NANOGP8Q6NSW7 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
NANOGP8Q6NSW7 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
NANOGP8Q6NSW7 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
NANOGP8Q6NSW7 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
NANOGP8Q6NSW7 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
NANOGP8Q6NSW7 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
NANOGP8Q6NSW7 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
NANOGP8Q6NSW7 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
NANOGP8Q6NSW7 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
NANOGP8Q6NSW7 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
NANOGP8Q6NSW7 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
NANOGP8Q6NSW7 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
NANOGP8Q6NSW7 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
NANOGP8Q6NSW7 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
NANOGP8Q6NSW7 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
NANOGP8Q6NSW7 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
NANOGP8Q6NSW7 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
NANOGP8Q6NSW7 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
NANOGP8Q6NSW7 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
NANOGP8Q6NSW7 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
NANOGP8Q6NSW7 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
NANOGP8Q6NSW7 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
NANOGP8Q6NSW7 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC19.92■□□□□ 0.78
NANOGP8Q6NSW7 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
NANOGP8Q6NSW7 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
NANOGP8Q6NSW7 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
NANOGP8Q6NSW7 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
NANOGP8Q6NSW7 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
NANOGP8Q6NSW7 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
NANOGP8Q6NSW7 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
NANOGP8Q6NSW7 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
NANOGP8Q6NSW7 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
NANOGP8Q6NSW7 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
NANOGP8Q6NSW7 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
NANOGP8Q6NSW7 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
NANOGP8Q6NSW7 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
NANOGP8Q6NSW7 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
NANOGP8Q6NSW7 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
NANOGP8Q6NSW7 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
NANOGP8Q6NSW7 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
NANOGP8Q6NSW7 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
NANOGP8Q6NSW7 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
NANOGP8Q6NSW7 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
NANOGP8Q6NSW7 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
NANOGP8Q6NSW7 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
NANOGP8Q6NSW7 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
NANOGP8Q6NSW7 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
NANOGP8Q6NSW7 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
NANOGP8Q6NSW7 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
NANOGP8Q6NSW7 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
NANOGP8Q6NSW7 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
NANOGP8Q6NSW7 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
NANOGP8Q6NSW7 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC19.9■□□□□ 0.78
NANOGP8Q6NSW7 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
NANOGP8Q6NSW7 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
NANOGP8Q6NSW7 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
NANOGP8Q6NSW7 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
NANOGP8Q6NSW7 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
NANOGP8Q6NSW7 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
NANOGP8Q6NSW7 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
NANOGP8Q6NSW7 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
NANOGP8Q6NSW7 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
NANOGP8Q6NSW7 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
NANOGP8Q6NSW7 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
NANOGP8Q6NSW7 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
NANOGP8Q6NSW7 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
NANOGP8Q6NSW7 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
NANOGP8Q6NSW7 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
NANOGP8Q6NSW7 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
NANOGP8Q6NSW7 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
NANOGP8Q6NSW7 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
NANOGP8Q6NSW7 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
NANOGP8Q6NSW7 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
NANOGP8Q6NSW7 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
NANOGP8Q6NSW7 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
NANOGP8Q6NSW7 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
NANOGP8Q6NSW7 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC19.89■□□□□ 0.77
NANOGP8Q6NSW7 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC19.89■□□□□ 0.77
NANOGP8Q6NSW7 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
NANOGP8Q6NSW7 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
NANOGP8Q6NSW7 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
NANOGP8Q6NSW7 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
NANOGP8Q6NSW7 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
NANOGP8Q6NSW7 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
NANOGP8Q6NSW7 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.1 ms