Protein–RNA interactions for Protein: Q6IPU0

CENPP, Centromere protein P, humanhuman

Predictions only

Length 288 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPPQ6IPU0 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CENPPQ6IPU0 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
CENPPQ6IPU0 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CENPPQ6IPU0 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CENPPQ6IPU0 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CENPPQ6IPU0 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CENPPQ6IPU0 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CENPPQ6IPU0 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CENPPQ6IPU0 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CENPPQ6IPU0 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CENPPQ6IPU0 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CENPPQ6IPU0 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CENPPQ6IPU0 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CENPPQ6IPU0 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CENPPQ6IPU0 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CENPPQ6IPU0 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CENPPQ6IPU0 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CENPPQ6IPU0 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CENPPQ6IPU0 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CENPPQ6IPU0 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CENPPQ6IPU0 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CENPPQ6IPU0 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CENPPQ6IPU0 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CENPPQ6IPU0 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CENPPQ6IPU0 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CENPPQ6IPU0 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CENPPQ6IPU0 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CENPPQ6IPU0 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CENPPQ6IPU0 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CENPPQ6IPU0 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CENPPQ6IPU0 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CENPPQ6IPU0 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CENPPQ6IPU0 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CENPPQ6IPU0 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CENPPQ6IPU0 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CENPPQ6IPU0 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CENPPQ6IPU0 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CENPPQ6IPU0 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CENPPQ6IPU0 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CENPPQ6IPU0 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CENPPQ6IPU0 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CENPPQ6IPU0 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CENPPQ6IPU0 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
CENPPQ6IPU0 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CENPPQ6IPU0 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CENPPQ6IPU0 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CENPPQ6IPU0 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CENPPQ6IPU0 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CENPPQ6IPU0 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CENPPQ6IPU0 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CENPPQ6IPU0 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CENPPQ6IPU0 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CENPPQ6IPU0 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CENPPQ6IPU0 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CENPPQ6IPU0 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CENPPQ6IPU0 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CENPPQ6IPU0 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CENPPQ6IPU0 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CENPPQ6IPU0 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
CENPPQ6IPU0 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CENPPQ6IPU0 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CENPPQ6IPU0 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CENPPQ6IPU0 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CENPPQ6IPU0 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CENPPQ6IPU0 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CENPPQ6IPU0 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CENPPQ6IPU0 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CENPPQ6IPU0 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CENPPQ6IPU0 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CENPPQ6IPU0 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CENPPQ6IPU0 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CENPPQ6IPU0 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CENPPQ6IPU0 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CENPPQ6IPU0 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CENPPQ6IPU0 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CENPPQ6IPU0 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CENPPQ6IPU0 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CENPPQ6IPU0 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CENPPQ6IPU0 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CENPPQ6IPU0 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CENPPQ6IPU0 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CENPPQ6IPU0 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CENPPQ6IPU0 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CENPPQ6IPU0 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CENPPQ6IPU0 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
CENPPQ6IPU0 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CENPPQ6IPU0 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CENPPQ6IPU0 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CENPPQ6IPU0 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CENPPQ6IPU0 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CENPPQ6IPU0 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CENPPQ6IPU0 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CENPPQ6IPU0 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CENPPQ6IPU0 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CENPPQ6IPU0 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CENPPQ6IPU0 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CENPPQ6IPU0 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
CENPPQ6IPU0 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CENPPQ6IPU0 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CENPPQ6IPU0 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.7 ms