Protein–RNA interactions for Protein: Q676U5

ATG16L1, Autophagy-related protein 16-1, humanhuman

Predictions only

Length 607 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG16L1Q676U5 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
ATG16L1Q676U5 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
ATG16L1Q676U5 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
ATG16L1Q676U5 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
ATG16L1Q676U5 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC20.79■□□□□ 0.92
ATG16L1Q676U5 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
ATG16L1Q676U5 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
ATG16L1Q676U5 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
ATG16L1Q676U5 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
ATG16L1Q676U5 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
ATG16L1Q676U5 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
ATG16L1Q676U5 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
ATG16L1Q676U5 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
ATG16L1Q676U5 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
ATG16L1Q676U5 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
ATG16L1Q676U5 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
ATG16L1Q676U5 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
ATG16L1Q676U5 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
ATG16L1Q676U5 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
ATG16L1Q676U5 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
ATG16L1Q676U5 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
ATG16L1Q676U5 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
ATG16L1Q676U5 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC20.78■□□□□ 0.92
ATG16L1Q676U5 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
ATG16L1Q676U5 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
ATG16L1Q676U5 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
ATG16L1Q676U5 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
ATG16L1Q676U5 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
ATG16L1Q676U5 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
ATG16L1Q676U5 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
ATG16L1Q676U5 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
ATG16L1Q676U5 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
ATG16L1Q676U5 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
ATG16L1Q676U5 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
ATG16L1Q676U5 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
ATG16L1Q676U5 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
ATG16L1Q676U5 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
ATG16L1Q676U5 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
ATG16L1Q676U5 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
ATG16L1Q676U5 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
ATG16L1Q676U5 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
ATG16L1Q676U5 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
ATG16L1Q676U5 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.77■□□□□ 0.92
ATG16L1Q676U5 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
ATG16L1Q676U5 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.91
ATG16L1Q676U5 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
ATG16L1Q676U5 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
ATG16L1Q676U5 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
ATG16L1Q676U5 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
ATG16L1Q676U5 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
ATG16L1Q676U5 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
ATG16L1Q676U5 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
ATG16L1Q676U5 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
ATG16L1Q676U5 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
ATG16L1Q676U5 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
ATG16L1Q676U5 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
ATG16L1Q676U5 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
ATG16L1Q676U5 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
ATG16L1Q676U5 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
ATG16L1Q676U5 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
ATG16L1Q676U5 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
ATG16L1Q676U5 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC20.76■□□□□ 0.91
ATG16L1Q676U5 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
ATG16L1Q676U5 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
ATG16L1Q676U5 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
ATG16L1Q676U5 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
ATG16L1Q676U5 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
ATG16L1Q676U5 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
ATG16L1Q676U5 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
ATG16L1Q676U5 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
ATG16L1Q676U5 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
ATG16L1Q676U5 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
ATG16L1Q676U5 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
ATG16L1Q676U5 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
ATG16L1Q676U5 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
ATG16L1Q676U5 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
ATG16L1Q676U5 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
ATG16L1Q676U5 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
ATG16L1Q676U5 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
ATG16L1Q676U5 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
ATG16L1Q676U5 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
ATG16L1Q676U5 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
ATG16L1Q676U5 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
ATG16L1Q676U5 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
ATG16L1Q676U5 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
ATG16L1Q676U5 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
ATG16L1Q676U5 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
ATG16L1Q676U5 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
ATG16L1Q676U5 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
ATG16L1Q676U5 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
ATG16L1Q676U5 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
ATG16L1Q676U5 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
ATG16L1Q676U5 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
ATG16L1Q676U5 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
ATG16L1Q676U5 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
ATG16L1Q676U5 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
ATG16L1Q676U5 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
ATG16L1Q676U5 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
ATG16L1Q676U5 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
ATG16L1Q676U5 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.2 ms