Protein–RNA interactions for Protein: Q5VXD3

SAMD13, Sterile alpha motif domain-containing protein 13, humanhuman

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Length 122 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SAMD13Q5VXD3 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SAMD13Q5VXD3 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SAMD13Q5VXD3 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SAMD13Q5VXD3 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC16■□□□□ 0.15
SAMD13Q5VXD3 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
SAMD13Q5VXD3 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SAMD13Q5VXD3 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SAMD13Q5VXD3 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SAMD13Q5VXD3 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SAMD13Q5VXD3 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SAMD13Q5VXD3 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SAMD13Q5VXD3 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SAMD13Q5VXD3 EMX2-201ENST00000442245 2710 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SAMD13Q5VXD3 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SAMD13Q5VXD3 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SAMD13Q5VXD3 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SAMD13Q5VXD3 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SAMD13Q5VXD3 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SAMD13Q5VXD3 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SAMD13Q5VXD3 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SAMD13Q5VXD3 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SAMD13Q5VXD3 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SAMD13Q5VXD3 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SAMD13Q5VXD3 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SAMD13Q5VXD3 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
SAMD13Q5VXD3 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SAMD13Q5VXD3 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SAMD13Q5VXD3 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SAMD13Q5VXD3 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SAMD13Q5VXD3 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SAMD13Q5VXD3 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SAMD13Q5VXD3 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SAMD13Q5VXD3 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SAMD13Q5VXD3 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SAMD13Q5VXD3 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
SAMD13Q5VXD3 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SAMD13Q5VXD3 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SAMD13Q5VXD3 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SAMD13Q5VXD3 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SAMD13Q5VXD3 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SAMD13Q5VXD3 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SAMD13Q5VXD3 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SAMD13Q5VXD3 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SAMD13Q5VXD3 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SAMD13Q5VXD3 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
SAMD13Q5VXD3 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SAMD13Q5VXD3 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SAMD13Q5VXD3 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SAMD13Q5VXD3 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SAMD13Q5VXD3 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SAMD13Q5VXD3 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SAMD13Q5VXD3 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SAMD13Q5VXD3 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SAMD13Q5VXD3 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SAMD13Q5VXD3 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SAMD13Q5VXD3 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SAMD13Q5VXD3 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SAMD13Q5VXD3 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SAMD13Q5VXD3 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SAMD13Q5VXD3 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SAMD13Q5VXD3 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SAMD13Q5VXD3 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SAMD13Q5VXD3 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SAMD13Q5VXD3 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SAMD13Q5VXD3 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SAMD13Q5VXD3 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SAMD13Q5VXD3 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SAMD13Q5VXD3 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SAMD13Q5VXD3 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
SAMD13Q5VXD3 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
SAMD13Q5VXD3 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SAMD13Q5VXD3 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SAMD13Q5VXD3 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SAMD13Q5VXD3 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SAMD13Q5VXD3 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SAMD13Q5VXD3 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SAMD13Q5VXD3 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SAMD13Q5VXD3 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SAMD13Q5VXD3 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SAMD13Q5VXD3 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SAMD13Q5VXD3 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SAMD13Q5VXD3 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SAMD13Q5VXD3 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SAMD13Q5VXD3 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SAMD13Q5VXD3 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
SAMD13Q5VXD3 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SAMD13Q5VXD3 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SAMD13Q5VXD3 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SAMD13Q5VXD3 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SAMD13Q5VXD3 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SAMD13Q5VXD3 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SAMD13Q5VXD3 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SAMD13Q5VXD3 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SAMD13Q5VXD3 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SAMD13Q5VXD3 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SAMD13Q5VXD3 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SAMD13Q5VXD3 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SAMD13Q5VXD3 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SAMD13Q5VXD3 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SAMD13Q5VXD3 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
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