Protein–RNA interactions for Protein: Q5T215

TRAPPC3L, Trafficking protein particle complex subunit 3-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 181 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC3LQ5T215 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC26.69■■□□□ 1.86
TRAPPC3LQ5T215 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
TRAPPC3LQ5T215 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
TRAPPC3LQ5T215 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
TRAPPC3LQ5T215 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC26.69■■□□□ 1.86
TRAPPC3LQ5T215 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
TRAPPC3LQ5T215 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
TRAPPC3LQ5T215 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
TRAPPC3LQ5T215 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
TRAPPC3LQ5T215 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
TRAPPC3LQ5T215 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
TRAPPC3LQ5T215 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
TRAPPC3LQ5T215 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
TRAPPC3LQ5T215 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
TRAPPC3LQ5T215 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
TRAPPC3LQ5T215 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
TRAPPC3LQ5T215 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
TRAPPC3LQ5T215 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
TRAPPC3LQ5T215 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
TRAPPC3LQ5T215 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
TRAPPC3LQ5T215 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
TRAPPC3LQ5T215 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
TRAPPC3LQ5T215 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
TRAPPC3LQ5T215 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
TRAPPC3LQ5T215 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
TRAPPC3LQ5T215 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
TRAPPC3LQ5T215 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.67■■□□□ 1.86
TRAPPC3LQ5T215 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
TRAPPC3LQ5T215 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
TRAPPC3LQ5T215 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
TRAPPC3LQ5T215 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
TRAPPC3LQ5T215 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
TRAPPC3LQ5T215 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
TRAPPC3LQ5T215 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
TRAPPC3LQ5T215 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
TRAPPC3LQ5T215 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
TRAPPC3LQ5T215 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
TRAPPC3LQ5T215 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
TRAPPC3LQ5T215 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
TRAPPC3LQ5T215 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
TRAPPC3LQ5T215 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
TRAPPC3LQ5T215 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
TRAPPC3LQ5T215 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
TRAPPC3LQ5T215 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
TRAPPC3LQ5T215 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
TRAPPC3LQ5T215 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
TRAPPC3LQ5T215 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC26.66■■□□□ 1.86
TRAPPC3LQ5T215 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
TRAPPC3LQ5T215 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
TRAPPC3LQ5T215 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
TRAPPC3LQ5T215 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
TRAPPC3LQ5T215 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
TRAPPC3LQ5T215 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
TRAPPC3LQ5T215 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
TRAPPC3LQ5T215 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.65■■□□□ 1.86
TRAPPC3LQ5T215 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC26.65■■□□□ 1.86
TRAPPC3LQ5T215 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
TRAPPC3LQ5T215 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
TRAPPC3LQ5T215 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
TRAPPC3LQ5T215 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
TRAPPC3LQ5T215 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
TRAPPC3LQ5T215 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
TRAPPC3LQ5T215 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
TRAPPC3LQ5T215 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
TRAPPC3LQ5T215 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
TRAPPC3LQ5T215 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC26.64■■□□□ 1.86
TRAPPC3LQ5T215 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
TRAPPC3LQ5T215 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
TRAPPC3LQ5T215 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
TRAPPC3LQ5T215 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
TRAPPC3LQ5T215 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
TRAPPC3LQ5T215 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
TRAPPC3LQ5T215 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
TRAPPC3LQ5T215 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
TRAPPC3LQ5T215 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
TRAPPC3LQ5T215 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
TRAPPC3LQ5T215 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
TRAPPC3LQ5T215 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
TRAPPC3LQ5T215 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
TRAPPC3LQ5T215 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
TRAPPC3LQ5T215 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
TRAPPC3LQ5T215 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
TRAPPC3LQ5T215 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
TRAPPC3LQ5T215 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
TRAPPC3LQ5T215 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
TRAPPC3LQ5T215 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC26.62■■□□□ 1.85
TRAPPC3LQ5T215 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC26.62■■□□□ 1.85
TRAPPC3LQ5T215 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
TRAPPC3LQ5T215 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
TRAPPC3LQ5T215 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
TRAPPC3LQ5T215 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
TRAPPC3LQ5T215 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
TRAPPC3LQ5T215 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
TRAPPC3LQ5T215 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
TRAPPC3LQ5T215 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
TRAPPC3LQ5T215 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
TRAPPC3LQ5T215 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
TRAPPC3LQ5T215 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
TRAPPC3LQ5T215 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
TRAPPC3LQ5T215 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69.3 ms