Protein–RNA interactions for Protein: Q5SZQ8

CELF3, CUGBP Elav-like family member 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 465 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CELF3Q5SZQ8 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CELF3Q5SZQ8 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
CELF3Q5SZQ8 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CELF3Q5SZQ8 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
CELF3Q5SZQ8 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CELF3Q5SZQ8 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CELF3Q5SZQ8 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CELF3Q5SZQ8 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
CELF3Q5SZQ8 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CELF3Q5SZQ8 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CELF3Q5SZQ8 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CELF3Q5SZQ8 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CELF3Q5SZQ8 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CELF3Q5SZQ8 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CELF3Q5SZQ8 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CELF3Q5SZQ8 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CELF3Q5SZQ8 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
CELF3Q5SZQ8 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CELF3Q5SZQ8 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CELF3Q5SZQ8 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CELF3Q5SZQ8 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CELF3Q5SZQ8 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
CELF3Q5SZQ8 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CELF3Q5SZQ8 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CELF3Q5SZQ8 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CELF3Q5SZQ8 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CELF3Q5SZQ8 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CELF3Q5SZQ8 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
CELF3Q5SZQ8 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CELF3Q5SZQ8 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CELF3Q5SZQ8 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CELF3Q5SZQ8 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CELF3Q5SZQ8 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CELF3Q5SZQ8 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CELF3Q5SZQ8 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
CELF3Q5SZQ8 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CELF3Q5SZQ8 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CELF3Q5SZQ8 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CELF3Q5SZQ8 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CELF3Q5SZQ8 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CELF3Q5SZQ8 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CELF3Q5SZQ8 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CELF3Q5SZQ8 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CELF3Q5SZQ8 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CELF3Q5SZQ8 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CELF3Q5SZQ8 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CELF3Q5SZQ8 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CELF3Q5SZQ8 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CELF3Q5SZQ8 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CELF3Q5SZQ8 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CELF3Q5SZQ8 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CELF3Q5SZQ8 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CELF3Q5SZQ8 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CELF3Q5SZQ8 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CELF3Q5SZQ8 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CELF3Q5SZQ8 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CELF3Q5SZQ8 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CELF3Q5SZQ8 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CELF3Q5SZQ8 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CELF3Q5SZQ8 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CELF3Q5SZQ8 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CELF3Q5SZQ8 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CELF3Q5SZQ8 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CELF3Q5SZQ8 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CELF3Q5SZQ8 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CELF3Q5SZQ8 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CELF3Q5SZQ8 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CELF3Q5SZQ8 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CELF3Q5SZQ8 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CELF3Q5SZQ8 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CELF3Q5SZQ8 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CELF3Q5SZQ8 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
CELF3Q5SZQ8 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CELF3Q5SZQ8 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CELF3Q5SZQ8 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CELF3Q5SZQ8 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
CELF3Q5SZQ8 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CELF3Q5SZQ8 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CELF3Q5SZQ8 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CELF3Q5SZQ8 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CELF3Q5SZQ8 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CELF3Q5SZQ8 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CELF3Q5SZQ8 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CELF3Q5SZQ8 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CELF3Q5SZQ8 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CELF3Q5SZQ8 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CELF3Q5SZQ8 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CELF3Q5SZQ8 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CELF3Q5SZQ8 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CELF3Q5SZQ8 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CELF3Q5SZQ8 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CELF3Q5SZQ8 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CELF3Q5SZQ8 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CELF3Q5SZQ8 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CELF3Q5SZQ8 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CELF3Q5SZQ8 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CELF3Q5SZQ8 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CELF3Q5SZQ8 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CELF3Q5SZQ8 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CELF3Q5SZQ8 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32 ms