Protein–RNA interactions for Protein: Q5JRX3

PITRM1, Presequence protease, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 1,037 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PITRM1Q5JRX3 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
PITRM1Q5JRX3 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PITRM1Q5JRX3 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PITRM1Q5JRX3 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PITRM1Q5JRX3 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PITRM1Q5JRX3 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PITRM1Q5JRX3 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PITRM1Q5JRX3 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PITRM1Q5JRX3 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PITRM1Q5JRX3 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PITRM1Q5JRX3 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PITRM1Q5JRX3 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PITRM1Q5JRX3 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PITRM1Q5JRX3 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PITRM1Q5JRX3 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PITRM1Q5JRX3 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PITRM1Q5JRX3 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PITRM1Q5JRX3 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PITRM1Q5JRX3 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
PITRM1Q5JRX3 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
PITRM1Q5JRX3 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
PITRM1Q5JRX3 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PITRM1Q5JRX3 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PITRM1Q5JRX3 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PITRM1Q5JRX3 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PITRM1Q5JRX3 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
PITRM1Q5JRX3 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PITRM1Q5JRX3 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
PITRM1Q5JRX3 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
PITRM1Q5JRX3 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PITRM1Q5JRX3 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PITRM1Q5JRX3 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
PITRM1Q5JRX3 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PITRM1Q5JRX3 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PITRM1Q5JRX3 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PITRM1Q5JRX3 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PITRM1Q5JRX3 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PITRM1Q5JRX3 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
PITRM1Q5JRX3 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PITRM1Q5JRX3 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
PITRM1Q5JRX3 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PITRM1Q5JRX3 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PITRM1Q5JRX3 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PITRM1Q5JRX3 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PITRM1Q5JRX3 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PITRM1Q5JRX3 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PITRM1Q5JRX3 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PITRM1Q5JRX3 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PITRM1Q5JRX3 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PITRM1Q5JRX3 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PITRM1Q5JRX3 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PITRM1Q5JRX3 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PITRM1Q5JRX3 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PITRM1Q5JRX3 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PITRM1Q5JRX3 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PITRM1Q5JRX3 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PITRM1Q5JRX3 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PITRM1Q5JRX3 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
PITRM1Q5JRX3 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PITRM1Q5JRX3 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PITRM1Q5JRX3 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PITRM1Q5JRX3 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PITRM1Q5JRX3 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PITRM1Q5JRX3 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PITRM1Q5JRX3 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PITRM1Q5JRX3 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PITRM1Q5JRX3 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PITRM1Q5JRX3 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PITRM1Q5JRX3 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PITRM1Q5JRX3 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
PITRM1Q5JRX3 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PITRM1Q5JRX3 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PITRM1Q5JRX3 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PITRM1Q5JRX3 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PITRM1Q5JRX3 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PITRM1Q5JRX3 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PITRM1Q5JRX3 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PITRM1Q5JRX3 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PITRM1Q5JRX3 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
PITRM1Q5JRX3 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
PITRM1Q5JRX3 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PITRM1Q5JRX3 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
PITRM1Q5JRX3 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PITRM1Q5JRX3 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
PITRM1Q5JRX3 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PITRM1Q5JRX3 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
PITRM1Q5JRX3 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
PITRM1Q5JRX3 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
PITRM1Q5JRX3 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC21.52■■□□□ 1.04
PITRM1Q5JRX3 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
PITRM1Q5JRX3 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
PITRM1Q5JRX3 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
PITRM1Q5JRX3 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PITRM1Q5JRX3 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
PITRM1Q5JRX3 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
PITRM1Q5JRX3 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PITRM1Q5JRX3 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PITRM1Q5JRX3 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC21.52■■□□□ 1.03
PITRM1Q5JRX3 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PITRM1Q5JRX3 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
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