Protein–RNA interactions for Protein: Q5GLZ8

HERC4, Probable E3 ubiquitin-protein ligase HERC4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,057 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC4Q5GLZ8 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
HERC4Q5GLZ8 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
HERC4Q5GLZ8 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
HERC4Q5GLZ8 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
HERC4Q5GLZ8 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
HERC4Q5GLZ8 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
HERC4Q5GLZ8 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
HERC4Q5GLZ8 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
HERC4Q5GLZ8 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
HERC4Q5GLZ8 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
HERC4Q5GLZ8 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
HERC4Q5GLZ8 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
HERC4Q5GLZ8 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
HERC4Q5GLZ8 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
HERC4Q5GLZ8 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
HERC4Q5GLZ8 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
HERC4Q5GLZ8 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
HERC4Q5GLZ8 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC23.46■■□□□ 1.35
HERC4Q5GLZ8 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
HERC4Q5GLZ8 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
HERC4Q5GLZ8 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC23.46■■□□□ 1.35
HERC4Q5GLZ8 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
HERC4Q5GLZ8 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
HERC4Q5GLZ8 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
HERC4Q5GLZ8 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
HERC4Q5GLZ8 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
HERC4Q5GLZ8 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
HERC4Q5GLZ8 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
HERC4Q5GLZ8 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
HERC4Q5GLZ8 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
HERC4Q5GLZ8 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
HERC4Q5GLZ8 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
HERC4Q5GLZ8 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
HERC4Q5GLZ8 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
HERC4Q5GLZ8 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
HERC4Q5GLZ8 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
HERC4Q5GLZ8 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
HERC4Q5GLZ8 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
HERC4Q5GLZ8 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
HERC4Q5GLZ8 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
HERC4Q5GLZ8 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
HERC4Q5GLZ8 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
HERC4Q5GLZ8 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
HERC4Q5GLZ8 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
HERC4Q5GLZ8 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
HERC4Q5GLZ8 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
HERC4Q5GLZ8 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
HERC4Q5GLZ8 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
HERC4Q5GLZ8 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
HERC4Q5GLZ8 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
HERC4Q5GLZ8 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
HERC4Q5GLZ8 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
HERC4Q5GLZ8 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
HERC4Q5GLZ8 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
HERC4Q5GLZ8 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
HERC4Q5GLZ8 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
HERC4Q5GLZ8 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
HERC4Q5GLZ8 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
HERC4Q5GLZ8 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
HERC4Q5GLZ8 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
HERC4Q5GLZ8 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
HERC4Q5GLZ8 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
HERC4Q5GLZ8 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
HERC4Q5GLZ8 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
HERC4Q5GLZ8 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
HERC4Q5GLZ8 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
HERC4Q5GLZ8 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC23.43■■□□□ 1.34
HERC4Q5GLZ8 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
HERC4Q5GLZ8 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
HERC4Q5GLZ8 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
HERC4Q5GLZ8 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
HERC4Q5GLZ8 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
HERC4Q5GLZ8 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
HERC4Q5GLZ8 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
HERC4Q5GLZ8 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
HERC4Q5GLZ8 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
HERC4Q5GLZ8 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
HERC4Q5GLZ8 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
HERC4Q5GLZ8 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
HERC4Q5GLZ8 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
HERC4Q5GLZ8 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
HERC4Q5GLZ8 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
HERC4Q5GLZ8 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
HERC4Q5GLZ8 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
HERC4Q5GLZ8 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
HERC4Q5GLZ8 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
HERC4Q5GLZ8 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
HERC4Q5GLZ8 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
HERC4Q5GLZ8 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
HERC4Q5GLZ8 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
HERC4Q5GLZ8 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
HERC4Q5GLZ8 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
HERC4Q5GLZ8 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
HERC4Q5GLZ8 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
HERC4Q5GLZ8 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
HERC4Q5GLZ8 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
HERC4Q5GLZ8 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
HERC4Q5GLZ8 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
HERC4Q5GLZ8 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
HERC4Q5GLZ8 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.1 ms