Protein–RNA interactions for Protein: Q5D1E8

ZC3H12A, Endoribonuclease ZC3H12A, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 599 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZC3H12AQ5D1E8 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ZC3H12AQ5D1E8 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ZC3H12AQ5D1E8 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ZC3H12AQ5D1E8 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ZC3H12AQ5D1E8 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ZC3H12AQ5D1E8 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ZC3H12AQ5D1E8 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ZC3H12AQ5D1E8 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ZC3H12AQ5D1E8 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ZC3H12AQ5D1E8 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ZC3H12AQ5D1E8 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ZC3H12AQ5D1E8 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ZC3H12AQ5D1E8 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
ZC3H12AQ5D1E8 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ZC3H12AQ5D1E8 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ZC3H12AQ5D1E8 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ZC3H12AQ5D1E8 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
ZC3H12AQ5D1E8 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ZC3H12AQ5D1E8 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ZC3H12AQ5D1E8 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ZC3H12AQ5D1E8 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ZC3H12AQ5D1E8 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ZC3H12AQ5D1E8 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ZC3H12AQ5D1E8 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ZC3H12AQ5D1E8 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
ZC3H12AQ5D1E8 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ZC3H12AQ5D1E8 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ZC3H12AQ5D1E8 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ZC3H12AQ5D1E8 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ZC3H12AQ5D1E8 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
ZC3H12AQ5D1E8 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
ZC3H12AQ5D1E8 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.12
ZC3H12AQ5D1E8 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ZC3H12AQ5D1E8 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ZC3H12AQ5D1E8 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ZC3H12AQ5D1E8 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ZC3H12AQ5D1E8 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ZC3H12AQ5D1E8 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ZC3H12AQ5D1E8 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ZC3H12AQ5D1E8 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ZC3H12AQ5D1E8 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
ZC3H12AQ5D1E8 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ZC3H12AQ5D1E8 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ZC3H12AQ5D1E8 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ZC3H12AQ5D1E8 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ZC3H12AQ5D1E8 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ZC3H12AQ5D1E8 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ZC3H12AQ5D1E8 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ZC3H12AQ5D1E8 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ZC3H12AQ5D1E8 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ZC3H12AQ5D1E8 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ZC3H12AQ5D1E8 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ZC3H12AQ5D1E8 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ZC3H12AQ5D1E8 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ZC3H12AQ5D1E8 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ZC3H12AQ5D1E8 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ZC3H12AQ5D1E8 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ZC3H12AQ5D1E8 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ZC3H12AQ5D1E8 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ZC3H12AQ5D1E8 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ZC3H12AQ5D1E8 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ZC3H12AQ5D1E8 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ZC3H12AQ5D1E8 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ZC3H12AQ5D1E8 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ZC3H12AQ5D1E8 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ZC3H12AQ5D1E8 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
ZC3H12AQ5D1E8 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ZC3H12AQ5D1E8 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ZC3H12AQ5D1E8 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ZC3H12AQ5D1E8 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ZC3H12AQ5D1E8 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ZC3H12AQ5D1E8 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ZC3H12AQ5D1E8 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ZC3H12AQ5D1E8 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ZC3H12AQ5D1E8 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ZC3H12AQ5D1E8 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ZC3H12AQ5D1E8 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ZC3H12AQ5D1E8 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ZC3H12AQ5D1E8 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ZC3H12AQ5D1E8 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ZC3H12AQ5D1E8 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ZC3H12AQ5D1E8 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ZC3H12AQ5D1E8 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ZC3H12AQ5D1E8 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ZC3H12AQ5D1E8 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ZC3H12AQ5D1E8 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ZC3H12AQ5D1E8 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ZC3H12AQ5D1E8 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ZC3H12AQ5D1E8 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ZC3H12AQ5D1E8 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
ZC3H12AQ5D1E8 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ZC3H12AQ5D1E8 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ZC3H12AQ5D1E8 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ZC3H12AQ5D1E8 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ZC3H12AQ5D1E8 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ZC3H12AQ5D1E8 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ZC3H12AQ5D1E8 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ZC3H12AQ5D1E8 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ZC3H12AQ5D1E8 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ZC3H12AQ5D1E8 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.3 ms