Protein–RNA interactions for Protein: Q58FG1

HSP90AA4P, Putative heat shock protein HSP 90-alpha A4, humanhuman

Predictions only

Length 418 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HSP90AA4PQ58FG1 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
HSP90AA4PQ58FG1 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
HSP90AA4PQ58FG1 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
HSP90AA4PQ58FG1 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
HSP90AA4PQ58FG1 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
HSP90AA4PQ58FG1 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
HSP90AA4PQ58FG1 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
HSP90AA4PQ58FG1 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
HSP90AA4PQ58FG1 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
HSP90AA4PQ58FG1 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
HSP90AA4PQ58FG1 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
HSP90AA4PQ58FG1 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
HSP90AA4PQ58FG1 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
HSP90AA4PQ58FG1 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
HSP90AA4PQ58FG1 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
HSP90AA4PQ58FG1 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
HSP90AA4PQ58FG1 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
HSP90AA4PQ58FG1 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
HSP90AA4PQ58FG1 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
HSP90AA4PQ58FG1 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
HSP90AA4PQ58FG1 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
HSP90AA4PQ58FG1 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
HSP90AA4PQ58FG1 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
HSP90AA4PQ58FG1 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
HSP90AA4PQ58FG1 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
HSP90AA4PQ58FG1 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
HSP90AA4PQ58FG1 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
HSP90AA4PQ58FG1 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
HSP90AA4PQ58FG1 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
HSP90AA4PQ58FG1 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
HSP90AA4PQ58FG1 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
HSP90AA4PQ58FG1 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
HSP90AA4PQ58FG1 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
HSP90AA4PQ58FG1 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
HSP90AA4PQ58FG1 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
HSP90AA4PQ58FG1 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
HSP90AA4PQ58FG1 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
HSP90AA4PQ58FG1 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
HSP90AA4PQ58FG1 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
HSP90AA4PQ58FG1 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
HSP90AA4PQ58FG1 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
HSP90AA4PQ58FG1 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
HSP90AA4PQ58FG1 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
HSP90AA4PQ58FG1 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
HSP90AA4PQ58FG1 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
HSP90AA4PQ58FG1 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
HSP90AA4PQ58FG1 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC23.27■■□□□ 1.32
HSP90AA4PQ58FG1 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
HSP90AA4PQ58FG1 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
HSP90AA4PQ58FG1 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
HSP90AA4PQ58FG1 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
HSP90AA4PQ58FG1 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
HSP90AA4PQ58FG1 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
HSP90AA4PQ58FG1 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
HSP90AA4PQ58FG1 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
HSP90AA4PQ58FG1 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
HSP90AA4PQ58FG1 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
HSP90AA4PQ58FG1 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
HSP90AA4PQ58FG1 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
HSP90AA4PQ58FG1 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.31
HSP90AA4PQ58FG1 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
HSP90AA4PQ58FG1 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
HSP90AA4PQ58FG1 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
HSP90AA4PQ58FG1 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC23.26■■□□□ 1.31
HSP90AA4PQ58FG1 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
HSP90AA4PQ58FG1 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
HSP90AA4PQ58FG1 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
HSP90AA4PQ58FG1 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
HSP90AA4PQ58FG1 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
HSP90AA4PQ58FG1 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
HSP90AA4PQ58FG1 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
HSP90AA4PQ58FG1 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
HSP90AA4PQ58FG1 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
HSP90AA4PQ58FG1 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
HSP90AA4PQ58FG1 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
HSP90AA4PQ58FG1 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
HSP90AA4PQ58FG1 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
HSP90AA4PQ58FG1 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
HSP90AA4PQ58FG1 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
HSP90AA4PQ58FG1 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
HSP90AA4PQ58FG1 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
HSP90AA4PQ58FG1 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
HSP90AA4PQ58FG1 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
HSP90AA4PQ58FG1 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
HSP90AA4PQ58FG1 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
HSP90AA4PQ58FG1 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
HSP90AA4PQ58FG1 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
HSP90AA4PQ58FG1 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
HSP90AA4PQ58FG1 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
HSP90AA4PQ58FG1 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
HSP90AA4PQ58FG1 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
HSP90AA4PQ58FG1 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
HSP90AA4PQ58FG1 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
HSP90AA4PQ58FG1 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
HSP90AA4PQ58FG1 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
HSP90AA4PQ58FG1 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
HSP90AA4PQ58FG1 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
HSP90AA4PQ58FG1 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
HSP90AA4PQ58FG1 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
HSP90AA4PQ58FG1 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.4 ms