Protein–RNA interactions for Protein: Q4LDE5

SVEP1, Sushi, von Willebrand factor type A, EGF and pentraxin domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 3,571 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SVEP1Q4LDE5 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SVEP1Q4LDE5 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SVEP1Q4LDE5 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SVEP1Q4LDE5 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SVEP1Q4LDE5 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SVEP1Q4LDE5 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SVEP1Q4LDE5 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SVEP1Q4LDE5 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SVEP1Q4LDE5 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SVEP1Q4LDE5 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SVEP1Q4LDE5 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SVEP1Q4LDE5 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SVEP1Q4LDE5 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SVEP1Q4LDE5 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SVEP1Q4LDE5 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SVEP1Q4LDE5 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SVEP1Q4LDE5 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SVEP1Q4LDE5 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SVEP1Q4LDE5 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SVEP1Q4LDE5 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SVEP1Q4LDE5 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SVEP1Q4LDE5 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SVEP1Q4LDE5 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SVEP1Q4LDE5 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SVEP1Q4LDE5 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SVEP1Q4LDE5 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SVEP1Q4LDE5 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SVEP1Q4LDE5 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SVEP1Q4LDE5 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SVEP1Q4LDE5 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SVEP1Q4LDE5 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SVEP1Q4LDE5 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SVEP1Q4LDE5 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SVEP1Q4LDE5 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SVEP1Q4LDE5 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SVEP1Q4LDE5 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SVEP1Q4LDE5 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SVEP1Q4LDE5 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SVEP1Q4LDE5 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SVEP1Q4LDE5 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
SVEP1Q4LDE5 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SVEP1Q4LDE5 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SVEP1Q4LDE5 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SVEP1Q4LDE5 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SVEP1Q4LDE5 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SVEP1Q4LDE5 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
SVEP1Q4LDE5 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
SVEP1Q4LDE5 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SVEP1Q4LDE5 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
SVEP1Q4LDE5 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
SVEP1Q4LDE5 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
SVEP1Q4LDE5 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
SVEP1Q4LDE5 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
SVEP1Q4LDE5 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
SVEP1Q4LDE5 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
SVEP1Q4LDE5 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
SVEP1Q4LDE5 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
SVEP1Q4LDE5 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
SVEP1Q4LDE5 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
SVEP1Q4LDE5 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
SVEP1Q4LDE5 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
SVEP1Q4LDE5 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
SVEP1Q4LDE5 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
SVEP1Q4LDE5 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
SVEP1Q4LDE5 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
SVEP1Q4LDE5 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
SVEP1Q4LDE5 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
SVEP1Q4LDE5 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
SVEP1Q4LDE5 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC17.27■□□□□ 0.35
SVEP1Q4LDE5 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
SVEP1Q4LDE5 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
SVEP1Q4LDE5 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SVEP1Q4LDE5 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SVEP1Q4LDE5 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC17.26■□□□□ 0.35
SVEP1Q4LDE5 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SVEP1Q4LDE5 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
SVEP1Q4LDE5 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
SVEP1Q4LDE5 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
SVEP1Q4LDE5 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
SVEP1Q4LDE5 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SVEP1Q4LDE5 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
SVEP1Q4LDE5 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SVEP1Q4LDE5 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
SVEP1Q4LDE5 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
SVEP1Q4LDE5 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SVEP1Q4LDE5 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
SVEP1Q4LDE5 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
SVEP1Q4LDE5 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
SVEP1Q4LDE5 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SVEP1Q4LDE5 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
SVEP1Q4LDE5 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
SVEP1Q4LDE5 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SVEP1Q4LDE5 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
SVEP1Q4LDE5 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SVEP1Q4LDE5 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SVEP1Q4LDE5 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
SVEP1Q4LDE5 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
SVEP1Q4LDE5 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
SVEP1Q4LDE5 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
SVEP1Q4LDE5 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.5 ms