Protein–RNA interactions for Protein: Q495D7

LINC01559, Putative uncharacterized protein encoded by LINC01559, humanhuman

Predictions only

Length 138 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC01559Q495D7 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
LINC01559Q495D7 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
LINC01559Q495D7 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
LINC01559Q495D7 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
LINC01559Q495D7 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
LINC01559Q495D7 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
LINC01559Q495D7 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
LINC01559Q495D7 Metazoa_SRP.67-201ENST00000617099 296 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
LINC01559Q495D7 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
LINC01559Q495D7 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
LINC01559Q495D7 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
LINC01559Q495D7 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
LINC01559Q495D7 FMN2-201ENST00000319653 6434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
LINC01559Q495D7 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
LINC01559Q495D7 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
LINC01559Q495D7 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
LINC01559Q495D7 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
LINC01559Q495D7 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
LINC01559Q495D7 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
LINC01559Q495D7 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
LINC01559Q495D7 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
LINC01559Q495D7 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
LINC01559Q495D7 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
LINC01559Q495D7 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
LINC01559Q495D7 GDF7-201ENST00000272224 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
LINC01559Q495D7 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
LINC01559Q495D7 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
LINC01559Q495D7 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
LINC01559Q495D7 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
LINC01559Q495D7 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
LINC01559Q495D7 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
LINC01559Q495D7 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
LINC01559Q495D7 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
LINC01559Q495D7 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
LINC01559Q495D7 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
LINC01559Q495D7 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
LINC01559Q495D7 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
LINC01559Q495D7 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
LINC01559Q495D7 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
LINC01559Q495D7 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
LINC01559Q495D7 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
LINC01559Q495D7 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
LINC01559Q495D7 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
LINC01559Q495D7 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
LINC01559Q495D7 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
LINC01559Q495D7 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
LINC01559Q495D7 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
LINC01559Q495D7 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
LINC01559Q495D7 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
LINC01559Q495D7 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
LINC01559Q495D7 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
LINC01559Q495D7 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
LINC01559Q495D7 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
LINC01559Q495D7 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
LINC01559Q495D7 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
LINC01559Q495D7 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
LINC01559Q495D7 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
LINC01559Q495D7 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
LINC01559Q495D7 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
LINC01559Q495D7 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
LINC01559Q495D7 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
LINC01559Q495D7 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
LINC01559Q495D7 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
LINC01559Q495D7 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
LINC01559Q495D7 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
LINC01559Q495D7 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
LINC01559Q495D7 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
LINC01559Q495D7 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
LINC01559Q495D7 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
LINC01559Q495D7 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
LINC01559Q495D7 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
LINC01559Q495D7 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
LINC01559Q495D7 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
LINC01559Q495D7 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
LINC01559Q495D7 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
LINC01559Q495D7 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
LINC01559Q495D7 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
LINC01559Q495D7 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
LINC01559Q495D7 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
LINC01559Q495D7 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
LINC01559Q495D7 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
LINC01559Q495D7 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
LINC01559Q495D7 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LINC01559Q495D7 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LINC01559Q495D7 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LINC01559Q495D7 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
LINC01559Q495D7 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LINC01559Q495D7 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
LINC01559Q495D7 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LINC01559Q495D7 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LINC01559Q495D7 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
LINC01559Q495D7 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
LINC01559Q495D7 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LINC01559Q495D7 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
LINC01559Q495D7 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LINC01559Q495D7 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
LINC01559Q495D7 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LINC01559Q495D7 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LINC01559Q495D7 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
LINC01559Q495D7 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.3 ms