Protein–RNA interactions for Protein: Q3MHD2

LSM12, Protein LSM12 homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 195 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LSM12Q3MHD2 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
LSM12Q3MHD2 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
LSM12Q3MHD2 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
LSM12Q3MHD2 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
LSM12Q3MHD2 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
LSM12Q3MHD2 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
LSM12Q3MHD2 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
LSM12Q3MHD2 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
LSM12Q3MHD2 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
LSM12Q3MHD2 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
LSM12Q3MHD2 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
LSM12Q3MHD2 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
LSM12Q3MHD2 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
LSM12Q3MHD2 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
LSM12Q3MHD2 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
LSM12Q3MHD2 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
LSM12Q3MHD2 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
LSM12Q3MHD2 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC20.43■□□□□ 0.86
LSM12Q3MHD2 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
LSM12Q3MHD2 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
LSM12Q3MHD2 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
LSM12Q3MHD2 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
LSM12Q3MHD2 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
LSM12Q3MHD2 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
LSM12Q3MHD2 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
LSM12Q3MHD2 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
LSM12Q3MHD2 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
LSM12Q3MHD2 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
LSM12Q3MHD2 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
LSM12Q3MHD2 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
LSM12Q3MHD2 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
LSM12Q3MHD2 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
LSM12Q3MHD2 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
LSM12Q3MHD2 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
LSM12Q3MHD2 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
LSM12Q3MHD2 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
LSM12Q3MHD2 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
LSM12Q3MHD2 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
LSM12Q3MHD2 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
LSM12Q3MHD2 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
LSM12Q3MHD2 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
LSM12Q3MHD2 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
LSM12Q3MHD2 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
LSM12Q3MHD2 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
LSM12Q3MHD2 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
LSM12Q3MHD2 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
LSM12Q3MHD2 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
LSM12Q3MHD2 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
LSM12Q3MHD2 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
LSM12Q3MHD2 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
LSM12Q3MHD2 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
LSM12Q3MHD2 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
LSM12Q3MHD2 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC20.4■□□□□ 0.86
LSM12Q3MHD2 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
LSM12Q3MHD2 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
LSM12Q3MHD2 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
LSM12Q3MHD2 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
LSM12Q3MHD2 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
LSM12Q3MHD2 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
LSM12Q3MHD2 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
LSM12Q3MHD2 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
LSM12Q3MHD2 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
LSM12Q3MHD2 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
LSM12Q3MHD2 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
LSM12Q3MHD2 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
LSM12Q3MHD2 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
LSM12Q3MHD2 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
LSM12Q3MHD2 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.86
LSM12Q3MHD2 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
LSM12Q3MHD2 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
LSM12Q3MHD2 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.86
LSM12Q3MHD2 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
LSM12Q3MHD2 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
LSM12Q3MHD2 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
LSM12Q3MHD2 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
LSM12Q3MHD2 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
LSM12Q3MHD2 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
LSM12Q3MHD2 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
LSM12Q3MHD2 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
LSM12Q3MHD2 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
LSM12Q3MHD2 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
LSM12Q3MHD2 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
LSM12Q3MHD2 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
LSM12Q3MHD2 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
LSM12Q3MHD2 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
LSM12Q3MHD2 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
LSM12Q3MHD2 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
LSM12Q3MHD2 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
LSM12Q3MHD2 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
LSM12Q3MHD2 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
LSM12Q3MHD2 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
LSM12Q3MHD2 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
LSM12Q3MHD2 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
LSM12Q3MHD2 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
LSM12Q3MHD2 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
LSM12Q3MHD2 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
LSM12Q3MHD2 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
LSM12Q3MHD2 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
LSM12Q3MHD2 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
LSM12Q3MHD2 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.3 ms