Protein–RNA interactions for Protein: Q3LI77

KRTAP13-4, Keratin-associated protein 13-4, humanhuman

Predictions only

Length 160 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP13-4Q3LI77 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
KRTAP13-4Q3LI77 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC9.76□□□□□ -0.85
KRTAP13-4Q3LI77 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC9.76□□□□□ -0.85
KRTAP13-4Q3LI77 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC9.76□□□□□ -0.85
KRTAP13-4Q3LI77 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.76□□□□□ -0.85
KRTAP13-4Q3LI77 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC9.76□□□□□ -0.85
KRTAP13-4Q3LI77 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
KRTAP13-4Q3LI77 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC9.76□□□□□ -0.85
KRTAP13-4Q3LI77 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC9.76□□□□□ -0.85
KRTAP13-4Q3LI77 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
KRTAP13-4Q3LI77 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC9.76□□□□□ -0.85
KRTAP13-4Q3LI77 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
KRTAP13-4Q3LI77 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC9.76□□□□□ -0.85
KRTAP13-4Q3LI77 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
KRTAP13-4Q3LI77 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
KRTAP13-4Q3LI77 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
KRTAP13-4Q3LI77 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC9.76□□□□□ -0.85
KRTAP13-4Q3LI77 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC9.76□□□□□ -0.85
KRTAP13-4Q3LI77 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
KRTAP13-4Q3LI77 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.76□□□□□ -0.85
KRTAP13-4Q3LI77 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC9.76□□□□□ -0.85
KRTAP13-4Q3LI77 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
KRTAP13-4Q3LI77 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
KRTAP13-4Q3LI77 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
KRTAP13-4Q3LI77 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC9.76□□□□□ -0.85
KRTAP13-4Q3LI77 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
KRTAP13-4Q3LI77 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC9.76□□□□□ -0.85
KRTAP13-4Q3LI77 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC9.76□□□□□ -0.85
KRTAP13-4Q3LI77 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC9.75□□□□□ -0.85
KRTAP13-4Q3LI77 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC9.75□□□□□ -0.85
KRTAP13-4Q3LI77 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.75□□□□□ -0.85
KRTAP13-4Q3LI77 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC9.75□□□□□ -0.85
KRTAP13-4Q3LI77 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
KRTAP13-4Q3LI77 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
KRTAP13-4Q3LI77 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
KRTAP13-4Q3LI77 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
KRTAP13-4Q3LI77 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
KRTAP13-4Q3LI77 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
KRTAP13-4Q3LI77 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
KRTAP13-4Q3LI77 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
KRTAP13-4Q3LI77 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
KRTAP13-4Q3LI77 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
KRTAP13-4Q3LI77 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
KRTAP13-4Q3LI77 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC9.75□□□□□ -0.85
KRTAP13-4Q3LI77 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
KRTAP13-4Q3LI77 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
KRTAP13-4Q3LI77 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC9.75□□□□□ -0.85
KRTAP13-4Q3LI77 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
KRTAP13-4Q3LI77 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC9.75□□□□□ -0.85
KRTAP13-4Q3LI77 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.75□□□□□ -0.85
KRTAP13-4Q3LI77 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.75□□□□□ -0.85
KRTAP13-4Q3LI77 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC9.75□□□□□ -0.85
KRTAP13-4Q3LI77 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
KRTAP13-4Q3LI77 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
KRTAP13-4Q3LI77 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
KRTAP13-4Q3LI77 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
KRTAP13-4Q3LI77 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
KRTAP13-4Q3LI77 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC9.75□□□□□ -0.85
KRTAP13-4Q3LI77 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
KRTAP13-4Q3LI77 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC9.75□□□□□ -0.85
KRTAP13-4Q3LI77 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
KRTAP13-4Q3LI77 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
KRTAP13-4Q3LI77 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC9.75□□□□□ -0.85
KRTAP13-4Q3LI77 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC9.75□□□□□ -0.85
KRTAP13-4Q3LI77 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
KRTAP13-4Q3LI77 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
KRTAP13-4Q3LI77 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
KRTAP13-4Q3LI77 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
KRTAP13-4Q3LI77 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC9.75□□□□□ -0.85
KRTAP13-4Q3LI77 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
KRTAP13-4Q3LI77 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
KRTAP13-4Q3LI77 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.74□□□□□ -0.85
KRTAP13-4Q3LI77 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
KRTAP13-4Q3LI77 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
KRTAP13-4Q3LI77 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
KRTAP13-4Q3LI77 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.74□□□□□ -0.85
KRTAP13-4Q3LI77 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
KRTAP13-4Q3LI77 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
KRTAP13-4Q3LI77 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC9.74□□□□□ -0.85
KRTAP13-4Q3LI77 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC9.74□□□□□ -0.85
KRTAP13-4Q3LI77 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC9.74□□□□□ -0.85
KRTAP13-4Q3LI77 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
KRTAP13-4Q3LI77 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC9.74□□□□□ -0.85
KRTAP13-4Q3LI77 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
KRTAP13-4Q3LI77 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
KRTAP13-4Q3LI77 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
KRTAP13-4Q3LI77 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
KRTAP13-4Q3LI77 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC9.74□□□□□ -0.85
KRTAP13-4Q3LI77 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
KRTAP13-4Q3LI77 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
KRTAP13-4Q3LI77 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC9.74□□□□□ -0.85
KRTAP13-4Q3LI77 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
KRTAP13-4Q3LI77 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
KRTAP13-4Q3LI77 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
KRTAP13-4Q3LI77 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC9.74□□□□□ -0.85
KRTAP13-4Q3LI77 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC9.74□□□□□ -0.85
KRTAP13-4Q3LI77 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
KRTAP13-4Q3LI77 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.73□□□□□ -0.85
KRTAP13-4Q3LI77 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
KRTAP13-4Q3LI77 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.73□□□□□ -0.85
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