Protein–RNA interactions for Protein: Q2KHR3

QSER1, Glutamine and serine-rich protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,735 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
QSER1Q2KHR3 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
QSER1Q2KHR3 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
QSER1Q2KHR3 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
QSER1Q2KHR3 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
QSER1Q2KHR3 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
QSER1Q2KHR3 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
QSER1Q2KHR3 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
QSER1Q2KHR3 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
QSER1Q2KHR3 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
QSER1Q2KHR3 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
QSER1Q2KHR3 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
QSER1Q2KHR3 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
QSER1Q2KHR3 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC26.77■■□□□ 1.88
QSER1Q2KHR3 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
QSER1Q2KHR3 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
QSER1Q2KHR3 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
QSER1Q2KHR3 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC26.77■■□□□ 1.88
QSER1Q2KHR3 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
QSER1Q2KHR3 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
QSER1Q2KHR3 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
QSER1Q2KHR3 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
QSER1Q2KHR3 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
QSER1Q2KHR3 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.88
QSER1Q2KHR3 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.88
QSER1Q2KHR3 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC26.76■■□□□ 1.88
QSER1Q2KHR3 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.88
QSER1Q2KHR3 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.88
QSER1Q2KHR3 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
QSER1Q2KHR3 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
QSER1Q2KHR3 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
QSER1Q2KHR3 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
QSER1Q2KHR3 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC26.76■■□□□ 1.87
QSER1Q2KHR3 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
QSER1Q2KHR3 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
QSER1Q2KHR3 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
QSER1Q2KHR3 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
QSER1Q2KHR3 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC26.75■■□□□ 1.87
QSER1Q2KHR3 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
QSER1Q2KHR3 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
QSER1Q2KHR3 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
QSER1Q2KHR3 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
QSER1Q2KHR3 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
QSER1Q2KHR3 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
QSER1Q2KHR3 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
QSER1Q2KHR3 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
QSER1Q2KHR3 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
QSER1Q2KHR3 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
QSER1Q2KHR3 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
QSER1Q2KHR3 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
QSER1Q2KHR3 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
QSER1Q2KHR3 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC26.73■■□□□ 1.87
QSER1Q2KHR3 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
QSER1Q2KHR3 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
QSER1Q2KHR3 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC26.73■■□□□ 1.87
QSER1Q2KHR3 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
QSER1Q2KHR3 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
QSER1Q2KHR3 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
QSER1Q2KHR3 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
QSER1Q2KHR3 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
QSER1Q2KHR3 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
QSER1Q2KHR3 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
QSER1Q2KHR3 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
QSER1Q2KHR3 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
QSER1Q2KHR3 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC26.73■■□□□ 1.87
QSER1Q2KHR3 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC26.73■■□□□ 1.87
QSER1Q2KHR3 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
QSER1Q2KHR3 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
QSER1Q2KHR3 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
QSER1Q2KHR3 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
QSER1Q2KHR3 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
QSER1Q2KHR3 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
QSER1Q2KHR3 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
QSER1Q2KHR3 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
QSER1Q2KHR3 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
QSER1Q2KHR3 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
QSER1Q2KHR3 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC26.72■■□□□ 1.87
QSER1Q2KHR3 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
QSER1Q2KHR3 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.72■■□□□ 1.87
QSER1Q2KHR3 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
QSER1Q2KHR3 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
QSER1Q2KHR3 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.72■■□□□ 1.87
QSER1Q2KHR3 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
QSER1Q2KHR3 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
QSER1Q2KHR3 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
QSER1Q2KHR3 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
QSER1Q2KHR3 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
QSER1Q2KHR3 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
QSER1Q2KHR3 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
QSER1Q2KHR3 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
QSER1Q2KHR3 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
QSER1Q2KHR3 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
QSER1Q2KHR3 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
QSER1Q2KHR3 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
QSER1Q2KHR3 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
QSER1Q2KHR3 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
QSER1Q2KHR3 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
QSER1Q2KHR3 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
QSER1Q2KHR3 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
QSER1Q2KHR3 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC26.71■■□□□ 1.87
QSER1Q2KHR3 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.9 ms