Protein–RNA interactions for Protein: Q17RS7

GEN1, Flap endonuclease GEN homolog 1, humanhuman

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Length 908 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GEN1Q17RS7 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
GEN1Q17RS7 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
GEN1Q17RS7 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC21.76■■□□□ 1.07
GEN1Q17RS7 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
GEN1Q17RS7 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
GEN1Q17RS7 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
GEN1Q17RS7 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
GEN1Q17RS7 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
GEN1Q17RS7 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC21.75■■□□□ 1.07
GEN1Q17RS7 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC21.75■■□□□ 1.07
GEN1Q17RS7 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
GEN1Q17RS7 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
GEN1Q17RS7 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
GEN1Q17RS7 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
GEN1Q17RS7 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
GEN1Q17RS7 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
GEN1Q17RS7 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
GEN1Q17RS7 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
GEN1Q17RS7 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
GEN1Q17RS7 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
GEN1Q17RS7 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
GEN1Q17RS7 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
GEN1Q17RS7 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
GEN1Q17RS7 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
GEN1Q17RS7 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
GEN1Q17RS7 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
GEN1Q17RS7 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
GEN1Q17RS7 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
GEN1Q17RS7 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
GEN1Q17RS7 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
GEN1Q17RS7 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
GEN1Q17RS7 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
GEN1Q17RS7 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
GEN1Q17RS7 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
GEN1Q17RS7 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
GEN1Q17RS7 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
GEN1Q17RS7 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
GEN1Q17RS7 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
GEN1Q17RS7 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
GEN1Q17RS7 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
GEN1Q17RS7 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
GEN1Q17RS7 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
GEN1Q17RS7 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
GEN1Q17RS7 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
GEN1Q17RS7 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
GEN1Q17RS7 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
GEN1Q17RS7 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
GEN1Q17RS7 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
GEN1Q17RS7 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
GEN1Q17RS7 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
GEN1Q17RS7 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
GEN1Q17RS7 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
GEN1Q17RS7 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
GEN1Q17RS7 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
GEN1Q17RS7 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
GEN1Q17RS7 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
GEN1Q17RS7 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
GEN1Q17RS7 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
GEN1Q17RS7 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
GEN1Q17RS7 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
GEN1Q17RS7 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
GEN1Q17RS7 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
GEN1Q17RS7 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
GEN1Q17RS7 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
GEN1Q17RS7 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
GEN1Q17RS7 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
GEN1Q17RS7 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
GEN1Q17RS7 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
GEN1Q17RS7 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
GEN1Q17RS7 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
GEN1Q17RS7 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
GEN1Q17RS7 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
GEN1Q17RS7 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
GEN1Q17RS7 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
GEN1Q17RS7 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
GEN1Q17RS7 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
GEN1Q17RS7 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
GEN1Q17RS7 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
GEN1Q17RS7 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
GEN1Q17RS7 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
GEN1Q17RS7 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
GEN1Q17RS7 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
GEN1Q17RS7 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
GEN1Q17RS7 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
GEN1Q17RS7 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
GEN1Q17RS7 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
GEN1Q17RS7 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
GEN1Q17RS7 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
GEN1Q17RS7 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
GEN1Q17RS7 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
GEN1Q17RS7 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
GEN1Q17RS7 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.71■■□□□ 1.07
GEN1Q17RS7 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
GEN1Q17RS7 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
GEN1Q17RS7 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
GEN1Q17RS7 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC21.71■■□□□ 1.07
GEN1Q17RS7 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
GEN1Q17RS7 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
GEN1Q17RS7 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
GEN1Q17RS7 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.07
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