Protein–RNA interactions for Protein: Q16836

HADH, Hydroxyacyl-coenzyme A dehydrogenase, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 314 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HADHQ16836 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
HADHQ16836 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
HADHQ16836 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
HADHQ16836 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
HADHQ16836 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
HADHQ16836 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
HADHQ16836 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
HADHQ16836 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
HADHQ16836 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
HADHQ16836 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
HADHQ16836 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
HADHQ16836 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
HADHQ16836 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
HADHQ16836 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
HADHQ16836 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
HADHQ16836 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
HADHQ16836 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
HADHQ16836 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
HADHQ16836 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
HADHQ16836 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
HADHQ16836 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
HADHQ16836 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
HADHQ16836 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
HADHQ16836 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
HADHQ16836 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
HADHQ16836 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
HADHQ16836 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
HADHQ16836 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
HADHQ16836 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
HADHQ16836 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
HADHQ16836 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
HADHQ16836 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
HADHQ16836 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
HADHQ16836 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
HADHQ16836 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
HADHQ16836 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
HADHQ16836 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
HADHQ16836 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
HADHQ16836 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
HADHQ16836 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
HADHQ16836 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
HADHQ16836 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
HADHQ16836 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
HADHQ16836 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
HADHQ16836 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
HADHQ16836 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
HADHQ16836 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
HADHQ16836 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
HADHQ16836 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
HADHQ16836 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
HADHQ16836 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
HADHQ16836 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
HADHQ16836 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
HADHQ16836 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
HADHQ16836 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.1
HADHQ16836 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
HADHQ16836 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
HADHQ16836 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
HADHQ16836 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
HADHQ16836 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
HADHQ16836 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
HADHQ16836 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
HADHQ16836 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
HADHQ16836 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
HADHQ16836 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
HADHQ16836 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
HADHQ16836 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
HADHQ16836 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
HADHQ16836 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
HADHQ16836 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
HADHQ16836 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
HADHQ16836 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
HADHQ16836 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
HADHQ16836 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
HADHQ16836 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
HADHQ16836 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
HADHQ16836 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
HADHQ16836 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
HADHQ16836 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
HADHQ16836 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
HADHQ16836 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
HADHQ16836 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
HADHQ16836 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
HADHQ16836 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
HADHQ16836 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
HADHQ16836 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
HADHQ16836 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
HADHQ16836 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
HADHQ16836 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
HADHQ16836 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
HADHQ16836 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC21.92■■□□□ 1.1
HADHQ16836 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
HADHQ16836 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
HADHQ16836 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
HADHQ16836 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
HADHQ16836 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
HADHQ16836 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
HADHQ16836 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
HADHQ16836 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC21.91■■□□□ 1.1
HADHQ16836 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.3 ms