Protein–RNA interactions for Protein: Q16572

SLC18A3, Vesicular acetylcholine transporter, humanhuman

Predictions only

Length 532 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC18A3Q16572 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SLC18A3Q16572 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SLC18A3Q16572 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SLC18A3Q16572 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SLC18A3Q16572 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SLC18A3Q16572 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SLC18A3Q16572 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SLC18A3Q16572 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SLC18A3Q16572 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SLC18A3Q16572 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
SLC18A3Q16572 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SLC18A3Q16572 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SLC18A3Q16572 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SLC18A3Q16572 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SLC18A3Q16572 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SLC18A3Q16572 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SLC18A3Q16572 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SLC18A3Q16572 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SLC18A3Q16572 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SLC18A3Q16572 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SLC18A3Q16572 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SLC18A3Q16572 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SLC18A3Q16572 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SLC18A3Q16572 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SLC18A3Q16572 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SLC18A3Q16572 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SLC18A3Q16572 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SLC18A3Q16572 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SLC18A3Q16572 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SLC18A3Q16572 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SLC18A3Q16572 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SLC18A3Q16572 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SLC18A3Q16572 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SLC18A3Q16572 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SLC18A3Q16572 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SLC18A3Q16572 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SLC18A3Q16572 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SLC18A3Q16572 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SLC18A3Q16572 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SLC18A3Q16572 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SLC18A3Q16572 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SLC18A3Q16572 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SLC18A3Q16572 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SLC18A3Q16572 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SLC18A3Q16572 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SLC18A3Q16572 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SLC18A3Q16572 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SLC18A3Q16572 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SLC18A3Q16572 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SLC18A3Q16572 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SLC18A3Q16572 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SLC18A3Q16572 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SLC18A3Q16572 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SLC18A3Q16572 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SLC18A3Q16572 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SLC18A3Q16572 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SLC18A3Q16572 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SLC18A3Q16572 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SLC18A3Q16572 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SLC18A3Q16572 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SLC18A3Q16572 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SLC18A3Q16572 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
SLC18A3Q16572 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
SLC18A3Q16572 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
SLC18A3Q16572 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
SLC18A3Q16572 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
SLC18A3Q16572 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SLC18A3Q16572 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SLC18A3Q16572 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SLC18A3Q16572 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SLC18A3Q16572 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SLC18A3Q16572 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SLC18A3Q16572 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SLC18A3Q16572 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SLC18A3Q16572 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SLC18A3Q16572 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
SLC18A3Q16572 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SLC18A3Q16572 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SLC18A3Q16572 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SLC18A3Q16572 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SLC18A3Q16572 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SLC18A3Q16572 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SLC18A3Q16572 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SLC18A3Q16572 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SLC18A3Q16572 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SLC18A3Q16572 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SLC18A3Q16572 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SLC18A3Q16572 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SLC18A3Q16572 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SLC18A3Q16572 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SLC18A3Q16572 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SLC18A3Q16572 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SLC18A3Q16572 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SLC18A3Q16572 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SLC18A3Q16572 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SLC18A3Q16572 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SLC18A3Q16572 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SLC18A3Q16572 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SLC18A3Q16572 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SLC18A3Q16572 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.7 ms