Protein–RNA interactions for Protein: Q16281

CNGA3, Cyclic nucleotide-gated cation channel alpha-3, humanhuman

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Length 694 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNGA3Q16281 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CNGA3Q16281 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CNGA3Q16281 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CNGA3Q16281 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CNGA3Q16281 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CNGA3Q16281 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CNGA3Q16281 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CNGA3Q16281 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CNGA3Q16281 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CNGA3Q16281 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CNGA3Q16281 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CNGA3Q16281 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CNGA3Q16281 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CNGA3Q16281 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CNGA3Q16281 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CNGA3Q16281 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CNGA3Q16281 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CNGA3Q16281 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
CNGA3Q16281 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CNGA3Q16281 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
CNGA3Q16281 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CNGA3Q16281 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
CNGA3Q16281 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CNGA3Q16281 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CNGA3Q16281 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CNGA3Q16281 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CNGA3Q16281 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CNGA3Q16281 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CNGA3Q16281 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CNGA3Q16281 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CNGA3Q16281 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CNGA3Q16281 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CNGA3Q16281 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CNGA3Q16281 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CNGA3Q16281 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CNGA3Q16281 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CNGA3Q16281 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CNGA3Q16281 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CNGA3Q16281 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CNGA3Q16281 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
CNGA3Q16281 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CNGA3Q16281 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CNGA3Q16281 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CNGA3Q16281 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CNGA3Q16281 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CNGA3Q16281 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CNGA3Q16281 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CNGA3Q16281 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CNGA3Q16281 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CNGA3Q16281 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CNGA3Q16281 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CNGA3Q16281 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CNGA3Q16281 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CNGA3Q16281 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CNGA3Q16281 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CNGA3Q16281 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CNGA3Q16281 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CNGA3Q16281 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
CNGA3Q16281 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CNGA3Q16281 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CNGA3Q16281 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CNGA3Q16281 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CNGA3Q16281 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
CNGA3Q16281 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CNGA3Q16281 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CNGA3Q16281 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CNGA3Q16281 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CNGA3Q16281 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CNGA3Q16281 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CNGA3Q16281 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CNGA3Q16281 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CNGA3Q16281 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CNGA3Q16281 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CNGA3Q16281 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC21.4■■□□□ 1.02
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CNGA3Q16281 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CNGA3Q16281 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CNGA3Q16281 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CNGA3Q16281 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CNGA3Q16281 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CNGA3Q16281 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
CNGA3Q16281 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC21.39■■□□□ 1.02
CNGA3Q16281 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
CNGA3Q16281 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CNGA3Q16281 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CNGA3Q16281 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CNGA3Q16281 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CNGA3Q16281 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CNGA3Q16281 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CNGA3Q16281 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CNGA3Q16281 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CNGA3Q16281 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CNGA3Q16281 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CNGA3Q16281 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CNGA3Q16281 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CNGA3Q16281 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
CNGA3Q16281 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CNGA3Q16281 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CNGA3Q16281 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
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