Protein–RNA interactions for Protein: Q16254

E2F4, Transcription factor E2F4, humanhuman

Predictions only

Length 413 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2F4Q16254 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
E2F4Q16254 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
E2F4Q16254 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC23.57■■□□□ 1.36
E2F4Q16254 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
E2F4Q16254 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
E2F4Q16254 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
E2F4Q16254 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
E2F4Q16254 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
E2F4Q16254 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
E2F4Q16254 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
E2F4Q16254 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
E2F4Q16254 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
E2F4Q16254 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC23.56■■□□□ 1.36
E2F4Q16254 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
E2F4Q16254 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
E2F4Q16254 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
E2F4Q16254 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
E2F4Q16254 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
E2F4Q16254 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
E2F4Q16254 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
E2F4Q16254 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
E2F4Q16254 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC23.55■■□□□ 1.36
E2F4Q16254 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
E2F4Q16254 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
E2F4Q16254 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
E2F4Q16254 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
E2F4Q16254 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
E2F4Q16254 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
E2F4Q16254 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
E2F4Q16254 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
E2F4Q16254 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
E2F4Q16254 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
E2F4Q16254 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
E2F4Q16254 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
E2F4Q16254 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
E2F4Q16254 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
E2F4Q16254 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
E2F4Q16254 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
E2F4Q16254 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.54■■□□□ 1.36
E2F4Q16254 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
E2F4Q16254 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
E2F4Q16254 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
E2F4Q16254 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
E2F4Q16254 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
E2F4Q16254 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
E2F4Q16254 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
E2F4Q16254 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
E2F4Q16254 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
E2F4Q16254 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
E2F4Q16254 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.53■■□□□ 1.36
E2F4Q16254 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
E2F4Q16254 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
E2F4Q16254 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
E2F4Q16254 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
E2F4Q16254 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
E2F4Q16254 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
E2F4Q16254 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
E2F4Q16254 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
E2F4Q16254 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
E2F4Q16254 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
E2F4Q16254 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
E2F4Q16254 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
E2F4Q16254 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
E2F4Q16254 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC23.52■■□□□ 1.36
E2F4Q16254 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
E2F4Q16254 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
E2F4Q16254 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
E2F4Q16254 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
E2F4Q16254 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
E2F4Q16254 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
E2F4Q16254 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
E2F4Q16254 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
E2F4Q16254 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
E2F4Q16254 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
E2F4Q16254 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
E2F4Q16254 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
E2F4Q16254 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
E2F4Q16254 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
E2F4Q16254 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
E2F4Q16254 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
E2F4Q16254 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
E2F4Q16254 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
E2F4Q16254 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
E2F4Q16254 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
E2F4Q16254 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
E2F4Q16254 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
E2F4Q16254 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
E2F4Q16254 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
E2F4Q16254 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
E2F4Q16254 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
E2F4Q16254 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
E2F4Q16254 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
E2F4Q16254 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
E2F4Q16254 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
E2F4Q16254 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
E2F4Q16254 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
E2F4Q16254 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
E2F4Q16254 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
E2F4Q16254 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
E2F4Q16254 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.2 ms