Protein–RNA interactions for Protein: Q15573

TAF1A, TATA box-binding protein-associated factor RNA polymerase I subunit A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 450 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TAF1AQ15573 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
TAF1AQ15573 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
TAF1AQ15573 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
TAF1AQ15573 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
TAF1AQ15573 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
TAF1AQ15573 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
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TAF1AQ15573 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
TAF1AQ15573 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
TAF1AQ15573 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
TAF1AQ15573 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
TAF1AQ15573 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
TAF1AQ15573 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
TAF1AQ15573 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
TAF1AQ15573 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
TAF1AQ15573 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
TAF1AQ15573 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
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TAF1AQ15573 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
TAF1AQ15573 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
TAF1AQ15573 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
TAF1AQ15573 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
TAF1AQ15573 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
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TAF1AQ15573 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
TAF1AQ15573 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
TAF1AQ15573 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
TAF1AQ15573 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
TAF1AQ15573 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
TAF1AQ15573 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
TAF1AQ15573 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC21.03■□□□□ 0.96
TAF1AQ15573 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
TAF1AQ15573 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
TAF1AQ15573 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
TAF1AQ15573 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
TAF1AQ15573 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
TAF1AQ15573 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
TAF1AQ15573 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
TAF1AQ15573 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
TAF1AQ15573 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
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TAF1AQ15573 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
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TAF1AQ15573 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
TAF1AQ15573 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
TAF1AQ15573 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
TAF1AQ15573 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
TAF1AQ15573 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
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TAF1AQ15573 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
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TAF1AQ15573 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
TAF1AQ15573 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
TAF1AQ15573 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
TAF1AQ15573 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
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TAF1AQ15573 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
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TAF1AQ15573 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
TAF1AQ15573 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC21.01■□□□□ 0.95
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TAF1AQ15573 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
TAF1AQ15573 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
TAF1AQ15573 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
TAF1AQ15573 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
TAF1AQ15573 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
TAF1AQ15573 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
TAF1AQ15573 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
TAF1AQ15573 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
TAF1AQ15573 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
TAF1AQ15573 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC21■□□□□ 0.95
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TAF1AQ15573 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
TAF1AQ15573 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
TAF1AQ15573 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC21■□□□□ 0.95
TAF1AQ15573 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
TAF1AQ15573 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
TAF1AQ15573 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
TAF1AQ15573 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
TAF1AQ15573 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
TAF1AQ15573 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
TAF1AQ15573 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
TAF1AQ15573 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
TAF1AQ15573 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
TAF1AQ15573 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
TAF1AQ15573 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
TAF1AQ15573 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC20.99■□□□□ 0.95
TAF1AQ15573 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
TAF1AQ15573 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
TAF1AQ15573 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC20.99■□□□□ 0.95
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