Protein–RNA interactions for Protein: Q15413

RYR3, Ryanodine receptor 3, humanhuman

Predictions only

Length 4,870 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RYR3Q15413 STK32A-AS1-201ENST00000504297 863 ntTSL 3 BASIC14.4□□□□□ -0.11
RYR3Q15413 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.4□□□□□ -0.11
RYR3Q15413 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.4□□□□□ -0.11
RYR3Q15413 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.4□□□□□ -0.11
RYR3Q15413 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.39□□□□□ -0.11
RYR3Q15413 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
RYR3Q15413 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
RYR3Q15413 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
RYR3Q15413 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
RYR3Q15413 BET1L-202ENST00000332865 533 ntTSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
RYR3Q15413 TSPO-202ENST00000337554 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
RYR3Q15413 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
RYR3Q15413 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.39□□□□□ -0.11
RYR3Q15413 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC14.39□□□□□ -0.11
RYR3Q15413 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.39□□□□□ -0.11
RYR3Q15413 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC14.39□□□□□ -0.11
RYR3Q15413 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC14.39□□□□□ -0.11
RYR3Q15413 AF186192.2-201ENST00000524514 423 ntTSL 3 BASIC14.39□□□□□ -0.11
RYR3Q15413 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC14.39□□□□□ -0.11
RYR3Q15413 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC14.39□□□□□ -0.11
RYR3Q15413 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
RYR3Q15413 DHRS4-203ENST00000397075 727 ntTSL 2 BASIC14.39□□□□□ -0.11
RYR3Q15413 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
RYR3Q15413 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
RYR3Q15413 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
RYR3Q15413 AC092183.1-201ENST00000469884 875 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
RYR3Q15413 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
RYR3Q15413 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
RYR3Q15413 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
RYR3Q15413 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
RYR3Q15413 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
RYR3Q15413 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
RYR3Q15413 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
RYR3Q15413 AL845331.1-201ENST00000424978 1190 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
RYR3Q15413 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
RYR3Q15413 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
RYR3Q15413 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
RYR3Q15413 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
RYR3Q15413 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
RYR3Q15413 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
RYR3Q15413 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
RYR3Q15413 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
RYR3Q15413 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
RYR3Q15413 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
RYR3Q15413 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
RYR3Q15413 LINC00910-203ENST00000587874 544 ntTSL 4 BASIC14.38□□□□□ -0.11
RYR3Q15413 AC008878.4-201ENST00000602083 293 ntTSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
RYR3Q15413 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
RYR3Q15413 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
RYR3Q15413 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
RYR3Q15413 BUB3-201ENST00000368858 1361 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
RYR3Q15413 UBE2E1-AS1-201ENST00000426702 778 ntTSL 3 BASIC14.37□□□□□ -0.11
RYR3Q15413 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
RYR3Q15413 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
RYR3Q15413 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
RYR3Q15413 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
RYR3Q15413 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
RYR3Q15413 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
RYR3Q15413 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
RYR3Q15413 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
RYR3Q15413 RAB42-202ENST00000465518 857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
RYR3Q15413 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
RYR3Q15413 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
RYR3Q15413 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
RYR3Q15413 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
RYR3Q15413 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
RYR3Q15413 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC14.36□□□□□ -0.11
RYR3Q15413 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
RYR3Q15413 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
RYR3Q15413 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC14.36□□□□□ -0.11
RYR3Q15413 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
RYR3Q15413 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
RYR3Q15413 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
RYR3Q15413 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
RYR3Q15413 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
RYR3Q15413 CCNG1-208ENST00000510664 994 ntTSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
RYR3Q15413 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
RYR3Q15413 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
RYR3Q15413 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
RYR3Q15413 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
RYR3Q15413 HOTTIP_1.1-201ENST00000620415 57 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
RYR3Q15413 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
RYR3Q15413 TMEM234-202ENST00000344461 721 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
RYR3Q15413 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC14.36□□□□□ -0.11
RYR3Q15413 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
RYR3Q15413 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
RYR3Q15413 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
RYR3Q15413 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
RYR3Q15413 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
RYR3Q15413 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
RYR3Q15413 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
RYR3Q15413 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC14.35□□□□□ -0.11
RYR3Q15413 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
RYR3Q15413 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
RYR3Q15413 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
RYR3Q15413 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
RYR3Q15413 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
RYR3Q15413 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
RYR3Q15413 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
RYR3Q15413 PDLIM4-202ENST00000379018 1006 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
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