Protein–RNA interactions for Protein: Q15139

PRKD1, Serine/threonine-protein kinase D1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 912 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKD1Q15139 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PRKD1Q15139 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PRKD1Q15139 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PRKD1Q15139 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PRKD1Q15139 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PRKD1Q15139 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PRKD1Q15139 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PRKD1Q15139 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PRKD1Q15139 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PRKD1Q15139 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PRKD1Q15139 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PRKD1Q15139 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PRKD1Q15139 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PRKD1Q15139 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PRKD1Q15139 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PRKD1Q15139 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PRKD1Q15139 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PRKD1Q15139 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PRKD1Q15139 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PRKD1Q15139 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PRKD1Q15139 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PRKD1Q15139 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PRKD1Q15139 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PRKD1Q15139 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PRKD1Q15139 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PRKD1Q15139 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PRKD1Q15139 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PRKD1Q15139 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PRKD1Q15139 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
PRKD1Q15139 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PRKD1Q15139 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PRKD1Q15139 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PRKD1Q15139 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PRKD1Q15139 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PRKD1Q15139 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PRKD1Q15139 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PRKD1Q15139 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PRKD1Q15139 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PRKD1Q15139 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
PRKD1Q15139 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PRKD1Q15139 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PRKD1Q15139 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PRKD1Q15139 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PRKD1Q15139 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PRKD1Q15139 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PRKD1Q15139 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PRKD1Q15139 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PRKD1Q15139 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PRKD1Q15139 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PRKD1Q15139 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PRKD1Q15139 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PRKD1Q15139 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PRKD1Q15139 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PRKD1Q15139 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PRKD1Q15139 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PRKD1Q15139 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PRKD1Q15139 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PRKD1Q15139 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PRKD1Q15139 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PRKD1Q15139 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PRKD1Q15139 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PRKD1Q15139 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PRKD1Q15139 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PRKD1Q15139 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PRKD1Q15139 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PRKD1Q15139 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PRKD1Q15139 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PRKD1Q15139 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PRKD1Q15139 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PRKD1Q15139 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PRKD1Q15139 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PRKD1Q15139 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PRKD1Q15139 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PRKD1Q15139 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC21.52■■□□□ 1.04
PRKD1Q15139 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PRKD1Q15139 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PRKD1Q15139 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
PRKD1Q15139 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PRKD1Q15139 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
PRKD1Q15139 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
PRKD1Q15139 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PRKD1Q15139 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
PRKD1Q15139 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
PRKD1Q15139 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC21.52■■□□□ 1.03
PRKD1Q15139 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PRKD1Q15139 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PRKD1Q15139 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PRKD1Q15139 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
PRKD1Q15139 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PRKD1Q15139 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PRKD1Q15139 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PRKD1Q15139 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PRKD1Q15139 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PRKD1Q15139 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PRKD1Q15139 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PRKD1Q15139 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
PRKD1Q15139 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PRKD1Q15139 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PRKD1Q15139 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PRKD1Q15139 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
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