Protein–RNA interactions for Protein: Q15059

BRD3, Bromodomain-containing protein 3, humanhuman

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Length 726 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRD3Q15059 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
BRD3Q15059 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
BRD3Q15059 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
BRD3Q15059 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
BRD3Q15059 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
BRD3Q15059 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
BRD3Q15059 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
BRD3Q15059 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
BRD3Q15059 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
BRD3Q15059 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
BRD3Q15059 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
BRD3Q15059 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
BRD3Q15059 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
BRD3Q15059 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
BRD3Q15059 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
BRD3Q15059 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
BRD3Q15059 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
BRD3Q15059 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
BRD3Q15059 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
BRD3Q15059 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
BRD3Q15059 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
BRD3Q15059 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
BRD3Q15059 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
BRD3Q15059 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
BRD3Q15059 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
BRD3Q15059 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
BRD3Q15059 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
BRD3Q15059 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
BRD3Q15059 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
BRD3Q15059 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
BRD3Q15059 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
BRD3Q15059 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
BRD3Q15059 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
BRD3Q15059 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
BRD3Q15059 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
BRD3Q15059 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
BRD3Q15059 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
BRD3Q15059 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
BRD3Q15059 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
BRD3Q15059 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
BRD3Q15059 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
BRD3Q15059 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
BRD3Q15059 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
BRD3Q15059 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
BRD3Q15059 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
BRD3Q15059 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
BRD3Q15059 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
BRD3Q15059 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC22.16■■□□□ 1.14
BRD3Q15059 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
BRD3Q15059 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
BRD3Q15059 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
BRD3Q15059 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
BRD3Q15059 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
BRD3Q15059 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
BRD3Q15059 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
BRD3Q15059 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
BRD3Q15059 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
BRD3Q15059 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
BRD3Q15059 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
BRD3Q15059 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
BRD3Q15059 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
BRD3Q15059 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
BRD3Q15059 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
BRD3Q15059 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
BRD3Q15059 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
BRD3Q15059 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
BRD3Q15059 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
BRD3Q15059 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
BRD3Q15059 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
BRD3Q15059 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
BRD3Q15059 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
BRD3Q15059 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
BRD3Q15059 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
BRD3Q15059 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
BRD3Q15059 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
BRD3Q15059 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
BRD3Q15059 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
BRD3Q15059 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
BRD3Q15059 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
BRD3Q15059 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
BRD3Q15059 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
BRD3Q15059 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
BRD3Q15059 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
BRD3Q15059 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
BRD3Q15059 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
BRD3Q15059 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
BRD3Q15059 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
BRD3Q15059 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
BRD3Q15059 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
BRD3Q15059 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
BRD3Q15059 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
BRD3Q15059 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
BRD3Q15059 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
BRD3Q15059 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
BRD3Q15059 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
BRD3Q15059 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
BRD3Q15059 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
BRD3Q15059 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
BRD3Q15059 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
BRD3Q15059 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.2 ms