Protein–RNA interactions for Protein: Q15050

RRS1, Ribosome biogenesis regulatory protein homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 365 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RRS1Q15050 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
RRS1Q15050 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
RRS1Q15050 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
RRS1Q15050 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
RRS1Q15050 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
RRS1Q15050 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
RRS1Q15050 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
RRS1Q15050 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
RRS1Q15050 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
RRS1Q15050 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
RRS1Q15050 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
RRS1Q15050 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
RRS1Q15050 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC28.28■■■□□ 2.12
RRS1Q15050 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
RRS1Q15050 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
RRS1Q15050 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC28.28■■■□□ 2.12
RRS1Q15050 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
RRS1Q15050 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
RRS1Q15050 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC28.28■■■□□ 2.12
RRS1Q15050 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
RRS1Q15050 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
RRS1Q15050 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
RRS1Q15050 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
RRS1Q15050 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC28.27■■■□□ 2.12
RRS1Q15050 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
RRS1Q15050 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
RRS1Q15050 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
RRS1Q15050 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC28.27■■■□□ 2.12
RRS1Q15050 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
RRS1Q15050 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC28.27■■■□□ 2.12
RRS1Q15050 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
RRS1Q15050 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
RRS1Q15050 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
RRS1Q15050 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.12
RRS1Q15050 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.12
RRS1Q15050 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
RRS1Q15050 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
RRS1Q15050 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
RRS1Q15050 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC28.26■■■□□ 2.11
RRS1Q15050 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
RRS1Q15050 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
RRS1Q15050 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
RRS1Q15050 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
RRS1Q15050 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
RRS1Q15050 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
RRS1Q15050 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
RRS1Q15050 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
RRS1Q15050 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
RRS1Q15050 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
RRS1Q15050 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
RRS1Q15050 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
RRS1Q15050 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
RRS1Q15050 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
RRS1Q15050 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
RRS1Q15050 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
RRS1Q15050 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
RRS1Q15050 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
RRS1Q15050 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
RRS1Q15050 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
RRS1Q15050 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
RRS1Q15050 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
RRS1Q15050 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
RRS1Q15050 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
RRS1Q15050 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
RRS1Q15050 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
RRS1Q15050 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC28.24■■■□□ 2.11
RRS1Q15050 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
RRS1Q15050 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
RRS1Q15050 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
RRS1Q15050 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
RRS1Q15050 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
RRS1Q15050 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
RRS1Q15050 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
RRS1Q15050 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC28.23■■■□□ 2.11
RRS1Q15050 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
RRS1Q15050 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
RRS1Q15050 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
RRS1Q15050 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC28.23■■■□□ 2.11
RRS1Q15050 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
RRS1Q15050 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
RRS1Q15050 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
RRS1Q15050 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
RRS1Q15050 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
RRS1Q15050 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
RRS1Q15050 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
RRS1Q15050 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
RRS1Q15050 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
RRS1Q15050 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
RRS1Q15050 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC28.22■■■□□ 2.11
RRS1Q15050 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC28.22■■■□□ 2.11
RRS1Q15050 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC28.22■■■□□ 2.11
RRS1Q15050 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
RRS1Q15050 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC28.22■■■□□ 2.11
RRS1Q15050 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
RRS1Q15050 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
RRS1Q15050 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
RRS1Q15050 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
RRS1Q15050 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
RRS1Q15050 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
RRS1Q15050 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.2 ms