Protein–RNA interactions for Protein: Q15029

EFTUD2, 116 kDa U5 small nuclear ribonucleoprotein component, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 972 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFTUD2Q15029 CERCAM-202ENST00000372842 5201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.613e-6■■■■■ 41.9
EFTUD2Q15029 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.611e-6■■■■■ 41.9
EFTUD2Q15029 SSR4-209ENST00000482902 2409 ntTSL 218.82■□□□□ 0.63e-6■■■■■ 41.9
EFTUD2Q15029 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.593e-6■■■■■ 41.9
EFTUD2Q15029 BCR-201ENST00000305877 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.593e-6■■■■■ 41.9
EFTUD2Q15029 FCHO1-212ENST00000596309 598 ntTSL 418.75■□□□□ 0.591e-6■■■■■ 41.9
EFTUD2Q15029 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.593e-6■■■■■ 41.9
EFTUD2Q15029 NOMO2-212ENST00000622306 4252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.593e-6■■■■■ 41.9
EFTUD2Q15029 CORO1B-204ENST00000537042 1954 ntTSL 518.73■□□□□ 0.592e-6■■■■■ 41.9
EFTUD2Q15029 INPP5A-203ENST00000368594 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.593e-6■■■■■ 41.9
EFTUD2Q15029 PKD1P5-202ENST00000538166 606 ntTSL 318.7■□□□□ 0.583e-6■■■■■ 41.9
EFTUD2Q15029 ELAC2-202ENST00000395962 2924 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.581e-6■■■■■ 41.9
EFTUD2Q15029 ACAD8-203ENST00000524426 1189 ntTSL 218.69■□□□□ 0.583e-6■■■■■ 41.9
EFTUD2Q15029 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.583e-6■■■■■ 41.9
EFTUD2Q15029 ATPAF1-214ENST00000576409 4158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.573e-6■■■■■ 41.9
EFTUD2Q15029 LRRC14-208ENST00000530854 730 ntTSL 318.62■□□□□ 0.573e-6■■■■■ 41.9
EFTUD2Q15029 KLC2-201ENST00000316924 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.572e-7■■■■■ 41.9
EFTUD2Q15029 FAM160A2-204ENST00000529360 1309 ntTSL 218.56■□□□□ 0.563e-6■■■■■ 41.9
EFTUD2Q15029 NOMO2-202ENST00000381474 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.553e-6■■■■■ 41.9
EFTUD2Q15029 TRAPPC10-203ENST00000422875 5267 ntTSL 1 (best)18.48■□□□□ 0.552e-15■■■■■ 41.9
EFTUD2Q15029 SETMAR-203ENST00000413809 1676 ntTSL 218.47■□□□□ 0.553e-6■■■■■ 41.9
EFTUD2Q15029 ELAC2-207ENST00000480891 2737 ntTSL 218.47■□□□□ 0.551e-6■■■■■ 41.9
EFTUD2Q15029 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.543e-6■■■■■ 41.9
EFTUD2Q15029 C1QBP-204ENST00000573406 767 ntTSL 218.42■□□□□ 0.543e-6■■■■■ 41.9
EFTUD2Q15029 POLRMT-208ENST00000592863 966 ntTSL 518.42■□□□□ 0.543e-6■■■■■ 41.9
EFTUD2Q15029 MTMR14-203ENST00000353332 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.531e-6■■■■■ 41.9
EFTUD2Q15029 CERCAM-201ENST00000372838 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.523e-6■■■■■ 41.9
EFTUD2Q15029 ZMYND11-214ENST00000509513 2065 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.523e-6■■■■■ 41.9
EFTUD2Q15029 AIFM3-214ENST00000483107 1325 ntTSL 518.32■□□□□ 0.523e-6■■■■■ 41.9
EFTUD2Q15029 ZNF664-214ENST00000546098 474 ntTSL 418.31■□□□□ 0.523e-6■■■■■ 41.9
EFTUD2Q15029 ELOVL1-211ENST00000482302 984 ntTSL 318.29■□□□□ 0.522e-6■■■■■ 41.9
EFTUD2Q15029 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.523e-6■■■■■ 41.9
EFTUD2Q15029 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.523e-6■■■■■ 41.9
EFTUD2Q15029 TADA1-201ENST00000367874 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.513e-6■■■■■ 41.9
EFTUD2Q15029 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.513e-6■■■■■ 41.9
EFTUD2Q15029 ZBTB1-205ENST00000556818 453 ntTSL 418.19■□□□□ 0.53e-6■■■■■ 41.9
EFTUD2Q15029 RAC3-204ENST00000585014 798 ntTSL 218.18■□□□□ 0.53e-6■■■■■ 41.9
EFTUD2Q15029 ELOVL1-207ENST00000470968 867 ntTSL 518.16■□□□□ 0.52e-6■■■■■ 41.9
EFTUD2Q15029 PLOD3-212ENST00000478082 1585 ntTSL 218.11■□□□□ 0.493e-6■■■■■ 41.9
EFTUD2Q15029 NOMO2-211ENST00000621364 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.493e-6■■■■■ 41.9
EFTUD2Q15029 CORO1B-208ENST00000545736 1037 ntTSL 218.09■□□□□ 0.493e-6■■■■■ 41.9
EFTUD2Q15029 SLC2A6-202ENST00000371899 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.493e-6■■■■■ 41.9
EFTUD2Q15029 DCP1B-201ENST00000280665 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.483e-6■■■■■ 41.9
EFTUD2Q15029 DCP1B-207ENST00000543381 2073 ntTSL 518.08■□□□□ 0.483e-6■■■■■ 41.9
EFTUD2Q15029 CTBP1-215ENST00000514596 648 ntTSL 218.06■□□□□ 0.483e-6■■■■■ 41.9
EFTUD2Q15029 STUB1-207ENST00000566181 510 ntTSL 318.06■□□□□ 0.483e-6■■■■■ 41.9
EFTUD2Q15029 PPP1R9B-202ENST00000612501 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.483e-6■■■■■ 41.9
EFTUD2Q15029 KLC2-203ENST00000394066 2591 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.473e-6■■■■■ 41.9
EFTUD2Q15029 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.473e-6■■■■■ 41.9
EFTUD2Q15029 PYCR3-201ENST00000220966 2678 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.473e-6■■■■■ 41.9
EFTUD2Q15029 ZNF664-211ENST00000542493 591 ntTSL 417.97■□□□□ 0.473e-6■■■■■ 41.9
EFTUD2Q15029 SETMAR-204ENST00000425046 1359 ntTSL 1 (best)17.96■□□□□ 0.473e-6■■■■■ 41.9
EFTUD2Q15029 CASP9-209ENST00000474305 1111 ntTSL 1 (best)17.96■□□□□ 0.472e-11■■■■■ 41.9
EFTUD2Q15029 RANBP9-201ENST00000011619 3113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.463e-6■■■■■ 41.9
EFTUD2Q15029 PTPRU-211ENST00000531385 737 ntTSL 217.94■□□□□ 0.463e-6■■■■■ 41.9
EFTUD2Q15029 CASP9-207ENST00000447522 954 ntTSL 317.92■□□□□ 0.462e-11■■■■■ 41.9
EFTUD2Q15029 NAA10-213ENST00000478177 573 ntTSL 1 (best)17.91■□□□□ 0.461e-6■■■■■ 41.9
EFTUD2Q15029 ITPK1-210ENST00000556603 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.463e-6■■■■■ 41.9
EFTUD2Q15029 WRAP73-210ENST00000497940 1101 ntTSL 217.89■□□□□ 0.453e-6■■■■■ 41.9
EFTUD2Q15029 ARHGAP33-201ENST00000007510 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.453e-6■■■■■ 41.9
EFTUD2Q15029 PBK-201ENST00000301905 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.443e-6■■■■■ 41.9
EFTUD2Q15029 WDR81-203ENST00000418841 582 ntTSL 317.8■□□□□ 0.443e-6■■■■■ 41.9
EFTUD2Q15029 TAF1B-203ENST00000404869 505 ntTSL 517.78■□□□□ 0.443e-6■■■■■ 41.9
EFTUD2Q15029 SLC2A6-201ENST00000371897 2301 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.433e-6■■■■■ 41.9
EFTUD2Q15029 SMUG1-209ENST00000505128 2607 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.423e-6■■■■■ 41.9
EFTUD2Q15029 FCHO1-201ENST00000252771 3118 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.421e-6■■■■■ 41.9
EFTUD2Q15029 PKD1-209ENST00000472659 661 ntTSL 317.66■□□□□ 0.423e-7■■■■■ 41.9
EFTUD2Q15029 LRRC14-205ENST00000529022 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.49e-7■■■■■ 41.9
EFTUD2Q15029 CRAMP1-202ENST00000397412 7772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.393e-6■■■■■ 41.9
EFTUD2Q15029 CTBP1-204ENST00000503594 1108 ntTSL 217.5■□□□□ 0.393e-6■■■■■ 41.9
EFTUD2Q15029 ARMC6-210ENST00000537263 1318 ntTSL 317.49■□□□□ 0.393e-6■■■■■ 41.9
EFTUD2Q15029 SSR4-201ENST00000320857 1671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.393e-6■■■■■ 41.9
EFTUD2Q15029 ELAC2-205ENST00000465825 2793 ntTSL 217.49■□□□□ 0.393e-6■■■■■ 41.9
EFTUD2Q15029 JADE2-202ENST00000361895 3212 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.393e-6■■■■■ 41.9
EFTUD2Q15029 NUP50-202ENST00000396096 1895 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.382e-11■■■■■ 41.9
EFTUD2Q15029 POLR3H-202ENST00000355209 4416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.383e-6■■■■■ 41.9
EFTUD2Q15029 NAA10-216ENST00000488481 569 ntTSL 217.42■□□□□ 0.381e-6■■■■■ 41.9
EFTUD2Q15029 ELAC2-203ENST00000426905 2671 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.381e-6■■■■■ 41.9
EFTUD2Q15029 TRAK1-207ENST00000469506 578 ntTSL 217.39■□□□□ 0.373e-6■■■■■ 41.9
EFTUD2Q15029 NFIC-211ENST00000641145 8399 ntBASIC17.39■□□□□ 0.372e-6■■■■■ 41.9
EFTUD2Q15029 NEDD1-209ENST00000557092 554 ntTSL 417.38■□□□□ 0.373e-6■■■■■ 41.9
EFTUD2Q15029 NEDD1-208ENST00000555806 565 ntTSL 417.38■□□□□ 0.373e-6■■■■■ 41.9
EFTUD2Q15029 ACSS1-201ENST00000323482 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.373e-6■■■■■ 41.9
EFTUD2Q15029 DIMT1-201ENST00000199320 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.371e-9■■■■■ 41.9
EFTUD2Q15029 LIMK1-203ENST00000435201 1883 ntTSL 1 (best)17.35■□□□□ 0.373e-6■■■■■ 41.9
EFTUD2Q15029 DDX19B-204ENST00000451014 1608 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.373e-6■■■■■ 41.9
EFTUD2Q15029 CRAMP1-201ENST00000293925 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.363e-6■■■■■ 41.9
EFTUD2Q15029 INAVA-205ENST00000526172 586 ntTSL 417.3■□□□□ 0.363e-6■■■■■ 41.9
EFTUD2Q15029 CHEK1-202ENST00000427383 1670 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.363e-6■■■■■ 41.9
EFTUD2Q15029 AP4M1-207ENST00000438383 1091 ntTSL 517.29■□□□□ 0.363e-6■■■■■ 41.9
EFTUD2Q15029 CD151-214ENST00000528867 545 ntTSL 417.28■□□□□ 0.363e-6■■■■■ 41.9
EFTUD2Q15029 JADE2-201ENST00000282605 2748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.353e-6■■■■■ 41.9
EFTUD2Q15029 RPS6KB2-208ENST00000526268 787 ntTSL 317.2■□□□□ 0.343e-6■■■■■ 41.9
EFTUD2Q15029 UTP4-209ENST00000567235 586 ntTSL 517.19■□□□□ 0.343e-6■■■■■ 41.9
EFTUD2Q15029 SMUG1-208ENST00000504797 470 ntTSL 317.17■□□□□ 0.343e-6■■■■■ 41.9
EFTUD2Q15029 TAF1B-201ENST00000263663 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.343e-6■■■■■ 41.9
EFTUD2Q15029 CARS2-205ENST00000480437 486 ntTSL 217.12■□□□□ 0.333e-6■■■■■ 41.9
EFTUD2Q15029 AC016876.1-202ENST00000572046 287 ntTSL 317.1■□□□□ 0.333e-6■■■■■ 41.9
EFTUD2Q15029 MUS81-210ENST00000529857 906 ntTSL 517.06■□□□□ 0.322e-10■■■■■ 41.9
EFTUD2Q15029 STUB1-208ENST00000566408 684 ntTSL 216.99■□□□□ 0.313e-6■■■■■ 41.9
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