Protein–RNA interactions for Protein: Q14123

PDE1C, Calcium/calmodulin-dependent 3',5'-cyclic nucleotide phosphodiesterase 1C, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 709 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE1CQ14123 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PDE1CQ14123 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PDE1CQ14123 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PDE1CQ14123 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PDE1CQ14123 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PDE1CQ14123 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PDE1CQ14123 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PDE1CQ14123 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PDE1CQ14123 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PDE1CQ14123 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PDE1CQ14123 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PDE1CQ14123 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PDE1CQ14123 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PDE1CQ14123 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PDE1CQ14123 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PDE1CQ14123 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PDE1CQ14123 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PDE1CQ14123 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PDE1CQ14123 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PDE1CQ14123 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PDE1CQ14123 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PDE1CQ14123 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PDE1CQ14123 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PDE1CQ14123 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PDE1CQ14123 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PDE1CQ14123 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
PDE1CQ14123 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PDE1CQ14123 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PDE1CQ14123 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PDE1CQ14123 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PDE1CQ14123 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PDE1CQ14123 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PDE1CQ14123 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PDE1CQ14123 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PDE1CQ14123 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PDE1CQ14123 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
PDE1CQ14123 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PDE1CQ14123 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PDE1CQ14123 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PDE1CQ14123 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PDE1CQ14123 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PDE1CQ14123 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PDE1CQ14123 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PDE1CQ14123 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PDE1CQ14123 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PDE1CQ14123 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PDE1CQ14123 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PDE1CQ14123 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PDE1CQ14123 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PDE1CQ14123 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
PDE1CQ14123 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PDE1CQ14123 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
PDE1CQ14123 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
PDE1CQ14123 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
PDE1CQ14123 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
PDE1CQ14123 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
PDE1CQ14123 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
PDE1CQ14123 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
PDE1CQ14123 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PDE1CQ14123 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
PDE1CQ14123 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.03
PDE1CQ14123 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
PDE1CQ14123 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
PDE1CQ14123 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PDE1CQ14123 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PDE1CQ14123 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PDE1CQ14123 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PDE1CQ14123 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PDE1CQ14123 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PDE1CQ14123 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PDE1CQ14123 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PDE1CQ14123 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PDE1CQ14123 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PDE1CQ14123 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PDE1CQ14123 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PDE1CQ14123 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PDE1CQ14123 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PDE1CQ14123 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PDE1CQ14123 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PDE1CQ14123 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
PDE1CQ14123 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PDE1CQ14123 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
PDE1CQ14123 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PDE1CQ14123 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
PDE1CQ14123 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PDE1CQ14123 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PDE1CQ14123 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PDE1CQ14123 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
PDE1CQ14123 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
PDE1CQ14123 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PDE1CQ14123 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PDE1CQ14123 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PDE1CQ14123 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PDE1CQ14123 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PDE1CQ14123 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PDE1CQ14123 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PDE1CQ14123 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PDE1CQ14123 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PDE1CQ14123 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PDE1CQ14123 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
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